利用PCR-DGGE技术指导高温油藏中功能微生物的分离

采用PCR-DGGE技术对高温油藏的微生物群落进行了多样性分析,并将得到的信息用于指导油藏微生物的分离.本研究通过PCR-DGGE技术对油藏水样中DNA的16S rDNA V3、V8、V9 3个高可变区的扩增产物进行了比较,确定采用可得到更多微生物多样性信息的V9区引物进行PCR扩增,优势条带序列分析表明,在高温油藏中存在的微生物与GenBank数据库中α,β,y-变形杆菌和芽孢杆菌的序列相似性最高.利用多元细菌培养技术,以序列信息为指导,采用富集培养、直接培养和特殊培养的方法,从水样中分离出5株高温菌(而传统分离方法只能获得3株),其中3株高温解烃菌分别属于Bacillus属、Geobacillus属和Petrobacter属,它们能够在55℃以上兼性厌氧条件良好生长,对原油的降解率分别为56.5%、70.01%和31.87%,对原油的降粘率分别为40%、54.55%和29.09%,使原油的凝固点分别降低3.7、5.2和3.1℃.因此,序列指导和改变培养条件是分离更多有效采油微生物的改进方法,这3株高温菌的对原油的作用效果证明其具备提高石油采收率的潜力.     

太湖不同湖区真核微型浮游生物基因多样性的研究

用DGGE(denatured gradient gel electrophoresis)和构建18S rDNA克隆文库2种方法对太湖不同湖区的真核微型浮游生物(0.8～20μm)多样性及组成结构进行了研究.DGGE结果表明,不同湖区真核微型浮游生物的DGGE指纹图谱存在明显差异,其中营养水平较低的东太湖和贡湖DGGE条带数最多,分别为23和24,香农多样性指数分别为3.135和3.178,而营养水平较高的梅梁湾和五里湖最少,均为18,香农多样性指数为2.890,表明营养水平较低湖区的多样性高于营养水平较高的湖区.克隆测序结果表明太湖中真核微型浮游生物种类车富,占优势的主要是一些鞭毛藻、异养鞭毛虫、纤毛虫和真菌,而营养水平不同的梅梁湾、湖心、东太湖中真核微型浮游生物组成明显不同.在营养水平较高的梅梁湾,28.6%的OUT(operational taxonomicunit)属于异养鞭毛虫,另外隐藻、金藻分别占22.9%和14.3%;在湖心,金藻的比例最大,占25.7%,另外比较多的是异养鞭毛虫和隐藻,分别为20.0%和14.3%;而营养水平较低的东太湖各类纤毛虫所占比份最大,为26.8%,异养鞭毛虫较少,仅占4.9%,另外真菌含量较高,占12.2%.     

Biodegradation of 4-aminobenzenesulfonate by Ralstonia sp. PBA and Hydrogenophaga sp. PBC isolated from textile wastewater treatment plant

A co-culture consisting of Hydrogenophaga sp. PBC and Ralstonia sp. PBA, isolated from textile wastewater treatment plant could tolerate up to 100 mM 4-aminobenzenesulfonate (4-ABS) and utilize it as sole carbon, nitrogen and sulfur source under aerobic condition. The biodegradation of 4-ABS resulted in the release of nitrogen and sulfur in the form of ammonium and sulfate respectively. Ninety-eight percent removal of chemical oxygen demand attributed to 20 mM of 4-ABS in cell-free supernatant could be achieved after 118 h. Effective biodegradation of 4-ABS occurred at pH ranging from 6 to 8. During batch culture with 4-ABS as sole carbon and nitrogen source, the ratio of strain PBA to PBC was dynamic and a critical concentration of strain PBA has to be reached in order to enable effective biodegradation of 4-ABS. Haldane inhibition model was used to fit the degradation rate at different initial concentrations and the parameters μ_max, K_s and K_i were determined to be 0.13 h⁻¹, 1.3 mM and 42 mM respectively. HPLC analyses revealed traced accumulation of 4-sulfocatechol and at least four unidentified metabolites during biodegradation. This is the first study to report on the characterization of 4-ABS-degrading bacterial consortium that was isolated from textile wastewater treatment plant.     

高效降酚菌株JY03的筛选及其降解特性研究

从绝缘材料厂排放的工业废水中分离得到一株能高效降解苯酚的菌株JY03,最高可耐受1.5 g/L的苯酚。通过形态观察、生理生化分析和16S rRNA序列分析,初步鉴定该菌属于棒状杆菌属（Corynebacterium sp.JY03）。JY03对苯酚降解最适条件为pH 7.5,温度32℃,苯酚浓度为0.6 g/L,时间为...     

一株芘的高效降解菌的选育及其降解性能研究

旨在为多环芳烃污染环境的生物修复提供微生物资源和科学依据,从某焦化厂曝气池的活性污泥中分离纯化出一株降解芘的优势菌株B-1,该菌株可在以芘为惟一碳源的培养基中生长繁殖,能利用芘的最高浓度为130 mg/L左右.经形态学观察、生理生化实验及l6S rDNA序列分析,初步判断菌株B-1为芽胞杆菌属.投菌量、芘初始浓度、pH...     

一株耐铜细菌的鉴定及富集特性的研究

从铜矿污染区的土壤中分离纯化得到一株耐铜菌株USTB-E,最高耐受浓度为560 mg/L,通过形态观察,生理生化鉴定及16S rDNA序列分析技术鉴定出此菌株为假单胞菌。该菌的最适生长温度为35℃,pH为6.0,渗透压为0.3%。为了研究该菌耐铜机理,实验对铜离子富集机理进行了动力学研究,研究结果表明,USTB-E菌对...     

一株大熊猫肠道厌氧纤维素菌的分离鉴定、系统发育分析及生物学特性的研究

从成都动物园健康大熊猫的肠道采集样品,富集分离获得一株典型的厌氧纤维素分解菌PD.分离菌是杆状,革兰氏阳性(G ),菌体大小为0.5μm×(3～5)μm,严格厌氧;生长温度为25～40℃,最适生长温度为38℃;pH范围5.0～9.0,最适pH7.2;在纤维素粉作碳源的琼脂培养基上菌落直径为1～3mm,白色透明斑;分离菌株不仅能利用纤维二糖、葡萄糖、蔗糖、淀粉、松三糖、覃糖等多种可溶性碳源,而且可以利用纤维素粉等不溶性碳源.同时,对菌株PD进行了16SrDNA的PCR扩增,并对扩增产物测序.对16SrDNA部分序列进行了分析,并构建了系统发育树,表明菌株PD属于梭菌属,与Clostridiumlentocellum(T)的16SrDNA序列具有92.2%相似性.图5表1参18     

双酚A降解菌的分离鉴定及其降解特性

从好氧堆肥反应器的渗滤液中分离到1株降解内分泌干扰物双酚A的细菌B-16.经过对其形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,该菌株初步鉴定为Achromobacter xylosoxidans.通过摇瓶实验考察了生长条件对双酚A降解的影响,得出该菌株降解双酚A的最佳条件是接种量为0.6%,初始pH值为7.0,温度为30℃.在该条件下,对菌株B-16对不同初始浓度双酚A的降解反应过程进行动力学分析,该降解反应在低浓度(3、5、10mg/L)时符合一级反应动力学特征,而在较高底物浓度(20 mg/L5、0 mg/L)下不能用一级反应动力学描述,双酚A的降解率在初始浓度为10 mg/L时达到最大值46.93%.     

酸性矿山废水区域沉积物中嗜酸菌多样性研究

采集了酸性矿山废水区域酸性沉积物样品,运用16S rDNA克隆文库技术和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,研究了沉积物中的嗜酸菌类群以及它们的群落结构.结果表明,沉积物中的嗜酸菌类型较新,大多数16S rDNA序列与已知序列的相似性均在97%以下.这些嗜酸菌主要为Acidobacteria,β/-γProteobacteria,δ-Proteobacteria,Nitrospira,Candidate Division TM7,low G+C Gram-positive类微生物.在这一酸性生态系统中,δ-Proteobacteria类细菌占据主导地位.对酸性沉积物中嗜酸菌多样性的研究有利于发现高效处理酸性矿山废水的方法.     

土壤镉胁迫下菲降解菌的筛选及其降解特性研究

以菲和镉为供试物,对沈抚灌区土壤中土著菌进行筛选试验,筛选出一株菲降解菌,命名为W.J,同时测定在不同浓度镉胁迫下,菲为单一碳源时W.J的生长情况.结果表明,在镉胁迫下W.J对菲具有一定的降解能力,镉30 mg/L时,60 h时菲降解率在65%以上.16s rDNA测序比对发现,W.J与Alcaligenes(产碱杆菌属)同源性最高,为99%.通过对W.J生长曲线的测定,发现其对数生长期为0～20 h,这为W.J菌株保存提供了一定的前提条件.高浓度镉在W.J的生长后期对其有明显的毒理效应.