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反向PCR法克隆芳香烃龙胆酸降解途径中诱导型龙胆酸1,2-加双氧酶基因
引用本文:赵渝,郭鲁申,徐亚同,陆贻通,高林.反向PCR法克隆芳香烃龙胆酸降解途径中诱导型龙胆酸1,2-加双氧酶基因[J].应用与环境生物学报,2007,13(1):87-92.
作者姓名:赵渝  郭鲁申  徐亚同  陆贻通  高林
作者单位:1. 华东师范大学资源与环境科学学院,上海,200062;上海师范大学生命与环境科学学院,上海,200234
2. 上海师范大学生命与环境科学学院,上海,200234
3. 华东师范大学资源与环境科学学院,上海,200062
4. 上海交通大学资源与环境系,上海,201101
基金项目:国家自然科学基金;国家重点基础研究发展计划(973计划);上海市重点基础研究项目;上海市重点学科建设项目
摘    要:龙胆酸1,2-加双氧酶(GDO)是芳香烃龙胆酸途径的一个关键酶.产碱假单胞菌P25X具有保守性与诱导性各一组GDO同工酶,突变株SNZ28的保守型龙胆酸1,2加双氧酶基因(GDOⅠ)被链霉素/奇霉素抗性基因打断,但在含有龙胆酸盐的基本培养基上,仍能明显观察到GDO的活性.由龙胆酸诱导生长的SNZ28全蛋白二维电泳结果分析,获得了一个与Ralstoniasp.U2的GDO酶有极高同源性的蛋白点.根据对该蛋白点的N端和Q-Tof测序的结果,设计了一对简并引物,克隆了诱导型GDO酶的片段,通过对此片段的分析,设计了逆向PCR引物,利用Southern blot杂交,确定了合适的限制性内切酶(SalⅠ和SphⅠ),以单一酶切的P25X基因组DNA自联后的产物为模板,进行反向PCR.测序表明,获得了一段1047bp与Ralstoniasp.U2.的龙胆酸1,2-加双氧酶具有极高同源性的序列.研究结果揭示了SNZ28中存在诱导型GDO酶.本文中也对不同来源的GDO酶进行了比较研究,其结果为进一步对生物降解基因的进化研究打下了基础.图4表2参16

关 键 词:芳香烃  龙胆酸  诱导酶  反向PCR法
收稿时间:2006-02-27
修稿时间:2006-05-10

Cloning and Sequencing of Inducible Enzyme in Aromatic Gentisate Degradative Pathway Using Inverse PCR Method
ZHAO Yu,GUO Lusheng,XU Yatong,LU Yitong,GAO Lin.Cloning and Sequencing of Inducible Enzyme in Aromatic Gentisate Degradative Pathway Using Inverse PCR Method[J].Chinese Journal of Applied and Environmental Biology,2007,13(1):87-92.
Authors:ZHAO Yu  GUO Lusheng  XU Yatong  LU Yitong  GAO Lin
Institution:1. College of Environmental Science and Resources, East China Normal University, Shanghai 200062, China;2 .College of Life and Environment Science, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China;3. Department of Environment and Resources, Shanghai Jiaotong University, Shanghai 201101, China
Abstract:
Keywords:aromatic hydrocarbon  gentisic acid  inducible enzyme  inverse PCR method
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