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| DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定 | |
| 引用本文： | 范京安,顾海丰,陈世界,莫帮辉,温演庆,何万兴,刘伟,曾晓茂.DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定[J].应用与环境生物学报,2009,15(2). |
| 作者姓名： | 范京安 顾海丰 陈世界 莫帮辉 温演庆 何万兴 刘伟 曾晓茂 |
| 作者单位： | 1. 四川出人境检验检疫局,成都,610041 2. 中国科学院成都生物研究所,成都,610041 3. 中国科学院成都计算机应用研究所,成都,610041 |
| 基金项目： | 国家内然科学基金，国家质检总局科技计划项目，国家重点基础研究发展规划(973计划)，中国科学院知识创新重要方向基金 |
| 摘 要： | 选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648 bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200 bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648 bp、160 bp、50 bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5'端160 bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalist-barcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.图2表1参29附1 |
| 关 键 词： | 实蝇科 COI基因 DNA条形码 微型DNA条形码 物种鉴定 |
Species Identification of 36 Kinds of Fruit Flies Based on Minimalist-barcode |
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| FAN Jingan,GU Haifeng,CHEN Shijie,MO Banghu,WEN Yanqing,HE Wanxing,LIU Wei,ZENG Xiaomao.Species Identification of 36 Kinds of Fruit Flies Based on Minimalist-barcode[J].Chinese Journal of Applied and Environmental Biology,2009,15(2). | |
| Authors: | FAN Jingan GU Haifeng CHEN Shijie MO Banghu WEN Yanqing HE Wanxing LIU Wei ZENG Xiaomao |
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