| 氨态氮对菲律宾蛤仔毒理机制研究的内参基因筛选 |
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| 引用本文： | 曹滕飞,丛明,李兆艳,赵建民,吕家森,李成华.氨态氮对菲律宾蛤仔毒理机制研究的内参基因筛选[J].生态毒理学报,2017,12(2):182-190. |
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| 作者姓名： | 曹滕飞 丛明 李兆艳 赵建民 吕家森 李成华 |
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| 作者单位： | 1. 宁波大学海洋学院,宁波,315211;2. 中国科学院烟台海岸带研究所,烟台,264003;3. 烟台大学生命学院,烟台,264005 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(41406132) |
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| 摘 要： | 为了准确和系统地分析NH_3-N对菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)毒性的分子机制,并对相关基因的转录组学数据进行验证,利用ge Norm和Normfinder这2种软件,以暴露30 d中不同时间点的鳃组织c DNA为模板,从18S r RNA(18S)、beta-actin(Actin)、beta-tubulin(Tubu)、elongation factor 1-alpha(EF1α)、cyclophilin A(Cy PA)、Ubiquitin(Ub)等6个备选管家基因中,筛选可以稳定表达的内参基因,作为转录组学分析的内参基因。以稀释50倍的鳃组织c DNA模板作为检测模板,ge Norm软件分析获得6对备选内参基因的表达稳定性依次为:EF1αCy PAActinTubuUb18S,较优内参为EF1α和Cy PA;Norm Finder软件分析获得6对备选内参基因的表达稳定性为:EF1αActinTubuCy PAUb18S,最优内参基因为EF1α。为了验证上述筛选结果,分别以EF1α和Cy PA作为内参基因研究unigene1的表达趋势,发现以EF1α为内参基因时,unigene1的q RT-PCR的表达趋势与其转录组表达倍数的变化趋势一致。因此确定NH_3-N暴露菲律宾蛤仔后,鳃组织中表达最为稳定的内参基因为EF1α。
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| 关 键 词： | 氨氮 菲律宾蛤仔 内参基因 |
| 收稿时间： | 2016/7/27 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/8/28 0:00:00 |
Selection of Reference Genes for Toxicological Mechanism Research on Ruditapes philippinarum Exposed to Ammonia Nitrogen |
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| Cao Tengfei,Cong Ming,Li Zhaoyan,Zhao Jianmin,Lv Jiasen,Li Chenghua.Selection of Reference Genes for Toxicological Mechanism Research on Ruditapes philippinarum Exposed to Ammonia Nitrogen[J].Asian Journal of Ecotoxicology,2017,12(2):182-190. |
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| Authors: | Cao Tengfei Cong Ming Li Zhaoyan Zhao Jianmin Lv Jiasen Li Chenghua |
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| Institution: | 1. School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo 315211, China
2. Yantai Institute of Coastal Zone Research, Chinese Academy of Sciences, Yantai 264003, China
3. College of Life Science, Yantai University, Yantai 264005, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ammonia nitrogen Ruditapes philippinarum reference gene |
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