利用基因芯片探讨五氯酚发育毒性的作用机制 |
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作者姓名: | 吴兆毅 胡平 赵庆顺 尹大强 |
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作者单位: | 南京大学环境学院,污染控制与资源化研究国家重点实验室,南京,210093;南京大学模式动物研究所,南京,210089;南京大学环境学院,污染控制与资源化研究国家重点实验室,南京,210093;同济大学长江水环境教育部重点实验室,上海,200092 |
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摘 要: | 0hpf斑马鱼胚胎经50μg/L五氯酚(PCP)暴露染毒8 h,提取其总RNA,与Affymetrix公司的斑马鱼基因组芯片杂交.发现与对照组相比,染毒样本中1 149个基因的表达显著增强(Signal log ratio1),501个基因的表达显著减弱(Signal log ratio-1).利用Chipinfo、Genmapp等生物信息学软件对差异表达基因进行了基因本体论功能分类和发育调控通路分析,结果显示,显著差异表达的基因涉及抗氧化、信号传导、翻译调节、转录调节等多个分子功能.五氯酚暴露后斑马鱼胚胎发育重要的调控通路BMP信号、ERK通路、FGF信号、Nodal信号的调控基因smad2、smad5、bmp4、bmp7f、lh、n-ras的表达发生了显著变化,Signal logratio分别为4.6、2.1、1.6、1.0、1.3、1.0.这些结果为进一步阐明五氯酚的发育毒性作用机制提供了标志物.
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关 键 词: | 五氯酚 斑马鱼 基因芯片 发育毒性 生物信息学 |
收稿时间: | 2008-12-01 |
修稿时间: | 2009-04-08 |
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