| 基于病毒宏基因组学鉴定水环境中噬菌体携带的新型耐药基因及其耐药特点分析 |
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| 引用本文： | 张红娜,常美洁,刘敬博,董梦洁,孙佳欣,翟真真.基于病毒宏基因组学鉴定水环境中噬菌体携带的新型耐药基因及其耐药特点分析[J].环境科学学报,2022,42(6):215-224. |
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| 作者姓名： | 张红娜 常美洁 刘敬博 董梦洁 孙佳欣 翟真真 |
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| 作者单位： | 1.河北经贸大学生物科学与工程学院，石家庄 050061;2.山东农业大学动物科技学院，泰安 271000;3.泰安市中心医院，泰安 271000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（No.81903282）；河北省省级大学生创新创业训练计划项目（No.S202011832011）；河北省自然科学基金项目（No.C2020207012）；山东省医药卫生科技发展计划项目（No.202012070823） |
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| 摘 要： | 水环境作为耐药基因的存储库，为耐药基因的水平转移和新型耐药基因的产生提供重要场所.但到目前为止，对水环境中病毒携带耐药基因的特征及其功能还知之甚少.因此以南四湖和东平湖为研究对象，利用病毒宏基因组学结合体外实验的方法探讨水环境中病毒携带新型耐药基因的情况及其耐药特点.通过分析病毒基因组的片段（reads）和重叠群（contigs），鉴定出多种耐药基因，包括AAC（6’）、Qnr A、Van Y、Vat和β-内酰胺酶基因.值得关注的是，通过核心序列比对和进化分析，挖掘出两种噬菌体携带的新型β-内酰胺酶基因blaNSDPV-1和blaNSVM-1.最小抑菌浓度试验表明，这两种编码新型β-内酰胺酶的耐药基因对临床常用头孢类和碳青霉烯类抗生素具有一定的耐药性.综上所述，水环境中噬菌体很可能在新型耐药基因的产生和耐药基因散播中起着重要的作用.另外，病毒宏基因组学结合体外实验是发现噬菌体携带新型耐药基因的重要方法.
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| 关 键 词： | 水环境 噬菌体 病毒宏基因组 新型耐药基因 耐药特点 |
| 收稿时间： | 2021/7/27 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/9/14 0:00:00 |
Identifying novel phage-harbored antibiotic resistance genes in water environments by viral metagenome and analyzing their antibiotic resistance profile |
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| ZHANG Hongn,CHANG Meijie,LIU Jingbo,DONG Mengjie,SUN Jiaxin,ZHAI Zhenzhen.Identifying novel phage-harbored antibiotic resistance genes in water environments by viral metagenome and analyzing their antibiotic resistance profile[J].Acta Scientiae Circumstantiae,2022,42(6):215-224. |
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| Authors: | ZHANG Hongn CHANG Meijie LIU Jingbo DONG Mengjie SUN Jiaxin ZHAI Zhenzhen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | aquatic environment phages vrial metagenome novel antibiotic resistance genes antibiotic resistance profile |
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