单细胞水平微流体技术筛选北极沉积物中的联苯降解菌 |
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引用本文: | 徐丰俊,刘泽钒,彭睿琪,张逸岚,沈超峰.单细胞水平微流体技术筛选北极沉积物中的联苯降解菌[J].环境科学学报,2022,42(9):1-8. |
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作者姓名: | 徐丰俊 刘泽钒 彭睿琪 张逸岚 沈超峰 |
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作者单位: | 1.浙江大学环境与资源学院,杭州 310058;2.浙江省水体污染控制与环境安全技术重点实验室,杭州 310058 |
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基金项目: | 浙江省重点研发计划(No.2021C03167);国家自然科学基金(No.21876149,42077125) |
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摘 要: | 极地环境微生物具有独特而丰富的多样性,是亟待开发的资源宝库.随着人类影响范围的扩大,极地环境中持久性有机污染物与石油 资源开采等造成的环境污染不容忽视,而利用土著微生物进行生物修复是一种理想的方法.为克服传统的基于富集驯化的稀释平板法分离 降解菌存在耗时长、筛选结果单一等缺点,建立了一种单细胞水平微流体筛选(Single-cell Level Isolation with Microfluidics,SLIM)技术.以北极沉积物为菌源,以联苯为底物,利用该技术成功筛选得到9株菌株,分属于4个菌属:Streptomyces、Micrococcus、Dermacoccus和Aspergillus;通过 稀释平板法筛选得到3株菌株,分属于Acidovorax、Chryseobacterium和Nocardia.通过两种方法得到的菌株完全不同.系统发育分析表明,SLIM技术筛选得到的菌株具有更加丰富的微生物多样性.通过对沉积物及各代富集驯化培养物的16S rRNA基因高通量测序发现,并非所有富集的菌属都能被稀释平板法分离,通过SLIM技术筛选得到的菌属在所有样品中的相对丰度都很低.本文建立的SLIM技术从单细胞水平实现了目标菌种的筛选,相比于稀释平板法,具有效率更高的优点,同时避免了菌种间竞争等造成的分离困难.本研究为极地环境中有机污染的生物修复及“微生物暗物质”资源的挖掘提供了新的思路与方法.
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关 键 词: | 单细胞水平微流体筛选(SLIM) 极地区域 有限稀释 有机污染物 石油污染 生物修复 微生物暗物质 |
收稿时间: | 2021/11/19 0:00:00 |
修稿时间: | 2021/12/8 0:00:00 |
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