基于Illumina RNA-Seq分析的三种内分泌干扰物对斑马鱼神经毒性效应与机制 |
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引用本文: | 郭子一,王伟伟,宋杰,王慧利.基于Illumina RNA-Seq分析的三种内分泌干扰物对斑马鱼神经毒性效应与机制[J].中国环境科学,2023(2):946-956. |
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作者姓名: | 郭子一 王伟伟 宋杰 王慧利 |
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作者单位: | 1. 苏州科技大学;2. 温州医科大学 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(32071617); |
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摘 要: | 三氯生、三氯卡班和双酚A均具内分泌干扰作用,但从转录组学层面上揭示其靶分子及神经毒性机制鲜有报道,因此,本文借助RNA-Seq测序获得它们暴露斑马鱼幼鱼的转录组数据,基于生物信息分析证明:三种药物暴毒组差异表达基因(DEGs)的GO功能和KEGG代谢途径富集在生物过程、细胞组成和分子功能上,富集的DEGs数量和功能均不同,在神经相关途径上均有富集,但具体信号通路和途径不同.PPI网络节点关联度计算发现:富集在神经通路的Hub基因也不同,且与神经标志功能基因之间存在丰富间接的互作网络.将DEGs与TCGA数据库中胶质母细胞瘤GBM突变基因整合,证实其环境暴露均有诱发GBM风险,但发生途径和调控信号通路不同,故从分子水平上解析了三种污染物诱导神经毒性机制的根源.
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关 键 词: | 内分泌干扰物 斑马鱼 转录组测序 神经毒性 神经胶质母细胞瘤 |
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