| 高通量测序研究松茸菌柄土壤细菌群落结构 |
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| 引用本文： | 叶雷,付雨,李强,王强峰,张波,邹捷,亢宗静,张笑萍,李小林.高通量测序研究松茸菌柄土壤细菌群落结构[J].应用与环境生物学报,2018(3). |
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| 作者姓名： | 叶雷 付雨 李强 王强峰 张波 邹捷 亢宗静 张笑萍 李小林 |
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| 作者单位： | 四川省农业科学院土壤肥料研究所;四川农业大学资源学院;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室;四川省农业科学院生物技术核技术研究所 |
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| 摘 要： | 为了解松茸-菌柄根际微生物互作关系,采用Illumina Hiseq 2500平台高通量测序方法,研究松茸菌柄附着土壤的细菌群落结构,分析微生物因素对松茸的形成和生长的影响.通过高通量测序共获得了6 730条质控序列,这些序列按照97%的相似度被分为928个操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs),这些OTUs又被分为22个细菌门、2个古细菌门、62个细菌纲、4个古细菌纲、90个细菌目、6个古细菌目、162个细菌科、7个古细菌科、275个细菌属、8个古细菌属.在门的水平,变形菌门(Proteobacteria)在所有样品中均占主导,且在松茸菌柄土壤样品中高于对照样品;从纲的水平来看,β-变形菌门(Beta-proteobacteria)占主导,且在松茸菌柄土壤样品中高于对照样品;从属的水平看,伯克氏菌属(Burkholderia)隶属于变形菌门,在松茸土壤样品中的丰度显著高于对照,表明变形菌门对松茸的生长可能具有积极贡献,尤其是伯克氏菌属.此外,一些菌可能对松茸的生长具有消极贡献,如Unknown-Ellin 60等.本研究表明,细菌可能参与了松茸的生长和子实体的形成,但与细菌的丰富度不成正相关,这对松茸的人工种植将具有重要理论指导意义.
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