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北京蔬菜地土壤中抗生素抗性基因与可移动元件的分布特征
引用本文:张汝凤,宋渊,高浩泽,程首涛,孙艳梅,王旭明.北京蔬菜地土壤中抗生素抗性基因与可移动元件的分布特征[J].环境科学,2020,41(1):385-393.
作者姓名:张汝凤  宋渊  高浩泽  程首涛  孙艳梅  王旭明
作者单位:中国农业大学生物学院,北京 100193;北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京 100097,中国农业大学生物学院,北京 100193,北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京 100097,北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京 100097,北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京 100097,北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京 100097
基金项目:国家自然科学基金青年科学基金项目(31800098);北京市农林科学院青年基金项目(QNJJ201829);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20170302);北京市自然科学基金项目(5192005);家禽产业技术体系北京市创新团队专项(BAIC04-2019)
摘    要:为揭示北京地区蔬菜土壤中抗生素抗性基因与可移动元件的分布特征应用高通量荧光定量PCR方法(HT-qPCR),选取北京3个区5个蔬菜基地进行调查研究.在蔬菜基地土壤中共检测到92~121种抗生素抗性基因,4~6种可移动元件,抗生素抗性基因及可移动元件按区分开.各蔬菜基地中共有且丰度较高的抗生素抗性基因型为:多重耐药类oprD、acrA-04和acrA-05,大环内酯类-林肯酰胺类-链阳性菌素B类抗生素抗性基因(MLSB)酰胺酶类fox5,万古霉素类vanC-03;共有可移动元件为intI1.蔬菜基地土壤中共检测到7种抗生素,含量较高的抗生素种类为恩诺沙星(ENR)、诺氟沙星(NOR)、土霉素(OTC)、磺胺甲噁唑(SMX).顺义区S1与S2蔬菜基地土壤中抗生素的种类与丰度均最高,依次是通州区T蔬菜基地、昌平区C2与C1蔬菜基地.相关性分析表明,蔬菜基地土壤中抗生素抗性基因丰度与抗生素丰度存在显著正相关(P 0.05).研究结果可为后续控制抗生素抗性基因的传播提供基础理论数据.

关 键 词:蔬菜土壤  抗生素  抗生素抗性基因(ARGs)  可移动性元件(MGEs)  高通量定量PCR
收稿时间:2019/7/9 0:00:00
修稿时间:2019/8/19 0:00:00

Distribution Characteristics of Antibiotic Resistance Genes and Mobile Genetic Elements in Beijing Vegetable Base Soils
ZHANG Ru-feng,SONG Yuan,GAO Hao-ze,CHENG Shou-tao,SUN Yan-mei and WANG Xu-ming.Distribution Characteristics of Antibiotic Resistance Genes and Mobile Genetic Elements in Beijing Vegetable Base Soils[J].Chinese Journal of Environmental Science,2020,41(1):385-393.
Authors:ZHANG Ru-feng  SONG Yuan  GAO Hao-ze  CHENG Shou-tao  SUN Yan-mei and WANG Xu-ming
Institution:College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing 100193, China;Beijing Agricultural Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Beijing 100097, China,College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing 100193, China,Beijing Agricultural Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Beijing 100097, China,Beijing Agricultural Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Beijing 100097, China,Beijing Agricultural Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Beijing 100097, China and Beijing Agricultural Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Beijing 100097, China
Abstract:
Keywords:vegetable soil  antibiotics  antibiotic resistance genes(ARGs)  mobile genetic elements (MGEs)  high-throughput quantitative PCR
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