基于环境DNA宏条形码的青岚湖自然保护区鱼类组成及分布特征 |
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作者姓名: | 史艳萍 屈婵娟 许旺 周春花 梁璐 王宇翔 任文伟 戴年华 徐晓娟 黎栩霞 计勇 吴小平 金斌松 |
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作者单位: | 南昌工程学院水利与生态工程学院, 江西 南昌 330099;江西鄱阳湖湿地保护与恢复国家长期科研基地, 江西鄱阳湖湿地生态系统国家定位观测研究站, 江西省流域生态演变与生物多样性重点实验室, 南昌大学生命科学学院和研究院, 江西 南昌 330031;同济大学环境科学与工程学院, 上海 200092;嘉兴同济环境研究院, 浙江 嘉兴 314051;广东省深圳生态环境监测中心站, 广东 深圳 518049;Department of Biology, Queen''s University, Ontario Kingston K7L 3N6;江西科学院, 江西 南昌 330029;赣江上游水文水资源监测中心, 江西 赣州 341000;江西鄱阳湖湿地保护与恢复国家长期科研基地, 江西鄱阳湖湿地生态系统国家定位观测研究站, 江西省流域生态演变与生物多样性重点实验室, 南昌大学生命科学学院和研究院, 江西 南昌 330031;杭州师范大学生命与环境科学学院, 浙江 杭州 310018 |
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摘 要: | 为探究在不同引物、不同参考数据库下环境DNA技术检测结果的差异,于2021年4月,采用环境DNA宏条形码技术分析了青岚湖鱼类多样性。选取16S rRNA及Cytb 2种引物,NCBI及本地数据库2种数据库,分别进行比对注释。结果表明:在青岚湖29个采样点中,共检测到7目15科43属64种鱼类,其中在16S-NCBI情形下获得4目9科19属20种鱼类,在16S-本地数据库情形下获得6目13科27属38种鱼类,在Cytb-NCBI情形下获得4目6科16属19种鱼类,在Cytb-本地数据库情形下获得2目5科15属20种鱼类。在青岚湖29个采样点中,鱼类更多地分布于湖面宽阔的中间地带(如S31附近),且南部较北部更少,鱼种的分布呈现一定的空间相似性。就研究区域而言,选择16S rRNA引物及本地数据库可以获得更全面的鱼类物种。通过与青岚湖鱼类历史数据比对发现,环境DNA技术在研究区域具有较强的适用性,如能选择适当的引物和本地数据库,可以更全面地反映研究区域的物种组成情况。
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关 键 词: | 环境DNA宏条形码 鄱阳湖 鱼类多样性 引物 参考数据库 |
收稿时间: | 2023-01-05 |
修稿时间: | 2023-06-11 |
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