| 椒江口海域沉积物微生物群落及其对环境因子的响应 |
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| 引用本文： | 黄备,邵君波,周斌,孟伟杰,罗韩燕.椒江口海域沉积物微生物群落及其对环境因子的响应[J].中国环境监测,2017,33(6):87-94. |
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| 作者姓名： | 黄备 邵君波 周斌 孟伟杰 罗韩燕 |
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| 作者单位： | 浙江省舟山海洋生态环境监测站, 浙江 舟山 316021,浙江省舟山海洋生态环境监测站, 浙江 舟山 316021,杭州师范大学, 浙江 杭州 311121,浙江省舟山海洋生态环境监测站, 浙江 舟山 316021,浙江省舟山海洋生态环境监测站, 浙江 舟山 316021 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划（2016YFC1401603）；国家自然科学基金资助项目（41206186）；浙江省科技厅公益重点项目（2014C23002）；浙江省环保厅科研项目（2012A033，2013A020，2016A012） |
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| 摘 要： | 微生物群落在有机污染物生物地球化学循环中起着十分关键的作用。微生物群落结构和多样性及其变化在一定程度上反映了土壤的质量。宏基因组学能够在整体水平解析微生物群落结构,真实地揭示原位环境中微生物群落的复杂性和多样性。应用Illumina Mi Seq宏基因组高通量测序技术,在椒江口海域沉积物中鉴定得到古菌和细菌共33门类,变形菌门为明显的优势门类,其序列数占总数的62.1%。其他较为丰富的门类包括绿弯菌门、放线菌门、拟杆菌门。采用mothur软件计算Ace、Chao、Shannon、Simpson指数,结果发现,Ace、Chao的均值分别为511、518,Shannon在5.0左右,Simpson接近于0.02,显示出海域沉积物中微生物多样性较高且差异较小。通过微生物门类多样性与环境因子的相关性分析发现,PCB101、盐度和γ-氯丹对微生物门水平的群落分布具有显著性影响。计算微生物门类组成与环境因子间Spearman相关系数并绘图分析,温度、盐度、pH与多个微生物门类的组成和分布呈现明显的相关关系。
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| 关 键 词： | 宏基因组 高通量测序 海洋沉积物 微生物群落 椒江口 |
| 收稿时间： | 2016/5/27 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/8/1 0:00:00 |
Study on Sedimental Microbial Community and Its Response to Environment Factors in Jiaojiang Estuary |
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| HUANG Bei,SHAO Junbo,ZHOU Bin,MENG Weijie and LUO Hanyan.Study on Sedimental Microbial Community and Its Response to Environment Factors in Jiaojiang Estuary[J].Environmental Monitoring in China,2017,33(6):87-94. |
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| Authors: | HUANG Bei SHAO Junbo ZHOU Bin MENG Weijie and LUO Hanyan |
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| Institution: | Zhejiang Provincial Zhoushan Marine Ecological Environmental Monitoring Station, Zhoushan 316021, China,Zhejiang Provincial Zhoushan Marine Ecological Environmental Monitoring Station, Zhoushan 316021, China,Hangzhou Normal University, Hangzhou 311121, China,Zhejiang Provincial Zhoushan Marine Ecological Environmental Monitoring Station, Zhoushan 316021, China and Zhejiang Provincial Zhoushan Marine Ecological Environmental Monitoring Station, Zhoushan 316021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | metagenomics high throughout sequencing marine sediment microbial community Jiaojiang Estuary |
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