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DNA提取方法对活性污泥微生物多样性PCR-DGGE检测的影响
引用本文:李鹏,毕学军,汝少国.DNA提取方法对活性污泥微生物多样性PCR-DGGE检测的影响[J].安全与环境学报,2007,7(2):53-57.
作者姓名:李鹏  毕学军  汝少国
作者单位:中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛 266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛 266003;青岛理工大学环境与市政工程学院,山东青岛 266033
基金项目:山东省优秀中青年科学家科研奖励基金 , 山东省青岛市自然科学基金
摘    要:评价超声波法、2种基于SDS的裂解法、改进的化学裂解法、微波法和冻融 玻璃珠 溶菌酶 SDS等6种DNA提取方法对活性污泥微生物多样性PCR-DGGE检测的影响.结果表明,2种不同的DNA纯化方式(溶液和胶纯化)及PCR扩增方式(直接和巢式PCR)对DGGE结果没有明显的影响,但不同的DNA提取方法对DGGE结果有明显的影响,其中2种基于SDS裂解法的DGGE条带较多,其提取的DNA产量(14.85μg/g湿重)和纯度(OD260:OD280>1.80)也最高;改进的化学裂解法和微波法次之;超声波法、冻融 玻璃珠 溶菌酶 SDS法较少.研究表明,DNA提取方法是影响活性污泥微生物多样性PCR-DGGE检测结果的关键因素,基于SDS的裂解法是用于活性污泥微生物多样性PCR-DGGE研究的一种简便、可靠的总DNA提取方法.

关 键 词:微生物生态学  活性污泥  DNA提取  PCR-DGGE  微生物多样性
文章编号:1009-6094(2007)02-0053-05
收稿时间:2006-12-31
修稿时间:2006年12月31日

On the influence of DNA extraction from activated sludge for denaturing gradient gel electrophoresis on microbial diversity analysis
LI Peng,BI Xue-jun,RU Shao-guo.On the influence of DNA extraction from activated sludge for denaturing gradient gel electrophoresis on microbial diversity analysis[J].Journal of Safety and Environment,2007,7(2):53-57.
Authors:LI Peng  BI Xue-jun  RU Shao-guo
Abstract:
Keywords:microbial ecology  activated sludge  DNA extraction  polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis  microbial diversity
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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