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高通量测序技术研究典型湖泊岸边陆向深层土壤中厌氧氨氧化细菌的群落结构
引用本文:庄林杰,夏超,田晴,朱艳彬,祝贵兵.高通量测序技术研究典型湖泊岸边陆向深层土壤中厌氧氨氧化细菌的群落结构[J].环境科学学报,2017,37(1):261-271.
作者姓名:庄林杰  夏超  田晴  朱艳彬  祝贵兵
作者单位:1. 东华大学环境科学与工程学院, 上海 201620;2. 中国科学院生态环境研究中心饮用水科学与技术重点实验室, 北京 100085,2. 中国科学院生态环境研究中心饮用水科学与技术重点实验室, 北京 100085;3. 安徽省水利水电勘测设计院勘测分院, 合肥 230088,东华大学环境科学与工程学院, 上海 201620,东华大学环境科学与工程学院, 上海 201620,中国科学院生态环境研究中心饮用水科学与技术重点实验室, 北京 100085
基金项目:国家自然科学基金(No.41322012,41671471);中国科学院战略性先导科技专项(No.XDB15020303);环境模拟与污染控制国家重点联合实验室专项经费项目(No.14L01ESPC);中国科学院饮用水科学与技术重点实验室2015年度自由研究课题(No.15Z07KLDWST);中国科学院青年创新促进会资助项目
摘    要:为研究具有富营养化特征的白洋淀湖泊岸边陆向深层土壤中厌氧氨氧化细菌的群落结构组成,针对厌氧氨氧化的功能基因hzs B(联氨合成酶关键基因)进行高通量测序.结果显示,白洋淀湖泊岸边陆向深层土壤共8个样品处理后共得到77082条序列,在相似度90%下聚类得到40个OTUs.多样性分析(OTUs水平)表明,在白洋淀湖泊岸边近湖岸交界处,上层土壤中厌氧氨氧化细菌的群落多样性要高于下层,而在远湖岸交界处则相反,下层土壤中厌氧氨氧化细菌的群落多样性要高于上层土壤.PCo A分析(OTUs水平)表明,近湖岸交界处采样点各不同深度土壤层之间的厌氧氨氧化细菌的群落结构更相似,而远湖岸界面处采样点各不同深度之间的厌氧氨氧化细菌的群落结构差异较大.群落结构分析表明,在白洋淀湖泊岸边陆向深层土壤中,序列隶属于Candidatus‘Brocadia anammoxidans’(34.07%)、Candidatus‘Brocadia fulgida’(24.66%)、Candidatus‘Jettenia sp.’(3.00%)、Candidatus‘Kuenenia sp.’(0.22%)、Candidatus‘Scalindua sp.’(0.08%)及与Genbank中已探明的厌氧氨氧化细菌亲缘关系较远的Anammox-like cluster(37.98%).相关性分析(p0.10)表明,在白洋淀湖泊岸边陆向深层土壤中,厌氧氨氧化细菌α-多样性指数中丰富度Chao指数与含水率(MC)呈负相关,多样性Shannon指数与氨氮(NH+4)呈负相关,优势度Simpson指数与NH+4呈正相关;但厌氧氨氧化细菌群落组成中Candidatus‘Brocadia anammoxidans’的富集与总碳(TC)及总硫(TS)含量呈正相关.综上,本文针对厌氧氨氧化功能基因hzs B扩增进行高通量测序,一定程度上揭示了具有富营养化特征的白洋淀湖泊岸边陆向深层土壤中厌氧氨氧化细菌的多样性、群落组成及其与土壤环境因子的关系.

关 键 词:厌氧氨氧化细菌  高通量测序  功能基因hzsB  深层土壤  群落结构
收稿时间:2016/6/17 0:00:00
修稿时间:9/2/2016 12:00:00 AM

Community structure of anaerobic ammonia oxidation bacteria in subsurface soil from riparian zone to land in Baiyangdian Lake using high-throughput sequencing technology
ZHUANG Linjie,XIA Chao,TIAN Qing,ZHU Yanbin and ZHU Guibing.Community structure of anaerobic ammonia oxidation bacteria in subsurface soil from riparian zone to land in Baiyangdian Lake using high-throughput sequencing technology[J].Acta Scientiae Circumstantiae,2017,37(1):261-271.
Authors:ZHUANG Linjie  XIA Chao  TIAN Qing  ZHU Yanbin and ZHU Guibing
Institution:1. College of Environmental Science and Engineering, Donghua University, Shanghai 201620;2. Key Laboratory of Drinking Water Science and Technology, Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100085,2. Key Laboratory of Drinking Water Science and Technology, Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100085;3. Anhui Survey and Design Institute of Water Conservancy and Hydropower Branch, Hefei 230088,College of Environmental Science and Engineering, Donghua University, Shanghai 201620,College of Environmental Science and Engineering, Donghua University, Shanghai 201620 and Key Laboratory of Drinking Water Science and Technology, Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100085
Abstract:
Keywords:anaerobic ammonium oxidation(anammox)  high-throughput sequencing  functional gene(hzsB)  subsurface soil  community structure
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