首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

镉胁迫对栾树幼苗不同组织部位转录组差异研究
引用本文:何其浩,周韬,孙吉康,王平,白磊,刘志明.镉胁迫对栾树幼苗不同组织部位转录组差异研究[J].环境科学学报,2022,42(6):467-481.
作者姓名:何其浩  周韬  孙吉康  王平  白磊  刘志明
作者单位:1.中南林业科技大学环境科学与工程学院,长沙410004;2.中南林业科技大学生命科学与技术学院,长沙410004;3.东新墨西哥大学,波塔利斯 88130
基金项目:湖南省研究生科研创新项目(栾树抗镉基因筛选与应用分析);中南林业科技大学研究生科技创新基金(No.CX202102074)
摘    要:随着重金属镉(Cd)污染日趋严重,找寻高效土壤Cd污染治理方法刻不容缓.以具有植物恢复潜力的栾树(Koelreuteria paniculata)作为研究对象,通过转录组学RNA-Seq测序研究不同浓度Cd胁迫后栾树地上部与根部基因表达与代谢通路的变化.转录组测序结果表明,共获得了65171条Unigenes,根中差异表达的基因显著多于茎叶,且下调表达的基因多于上调表达基因.GO富集结果表明,在Cd胁迫下细胞内核糖核蛋白复合物(Intracellular ribonucleoprotein complex)、核糖核蛋白复合物(Ribonucleoprotein complex)和大分子复合物(Macromolecular complex)是栾树根部差异表达基因主要富集部分.在地上部中,差异表达基因主要富集在膜内组分和膜部分.KEGG途径富集分析表明,在根部中核糖体(Ribosome)、吞噬体(Phagosome)和三羧酸循环(Citrate cycle(TCA cycle))是主要的富集途径.在叶中,植物激素信号转导通路显著富集.转录因子鉴定结果显示共有10种转录因子家族的基因差异表达...

关 键 词:栾树(Koelreuteria  paniculata)  镉胁迫  重金属  转录组测序(RNA-Seq)  差异表达基因
收稿时间:2021/8/9 0:00:00
修稿时间:2021/9/3 0:00:00
点击此处可从《环境科学学报》浏览原始摘要信息
点击此处可从《环境科学学报》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号