镉胁迫对栾树幼苗不同组织部位转录组差异研究 |
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引用本文: | 何其浩,周韬,孙吉康,王平,白磊,刘志明.镉胁迫对栾树幼苗不同组织部位转录组差异研究[J].环境科学学报,2022,42(6):467-481. |
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作者姓名: | 何其浩 周韬 孙吉康 王平 白磊 刘志明 |
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作者单位: | 1.中南林业科技大学环境科学与工程学院,长沙410004;2.中南林业科技大学生命科学与技术学院,长沙410004;3.东新墨西哥大学,波塔利斯 88130 |
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基金项目: | 湖南省研究生科研创新项目(栾树抗镉基因筛选与应用分析);中南林业科技大学研究生科技创新基金(No.CX202102074) |
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摘 要: | 随着重金属镉(Cd)污染日趋严重,找寻高效土壤Cd污染治理方法刻不容缓.以具有植物恢复潜力的栾树(Koelreuteria paniculata)作为研究对象,通过转录组学RNA-Seq测序研究不同浓度Cd胁迫后栾树地上部与根部基因表达与代谢通路的变化.转录组测序结果表明,共获得了65171条Unigenes,根中差异表达的基因显著多于茎叶,且下调表达的基因多于上调表达基因.GO富集结果表明,在Cd胁迫下细胞内核糖核蛋白复合物(Intracellular ribonucleoprotein complex)、核糖核蛋白复合物(Ribonucleoprotein complex)和大分子复合物(Macromolecular complex)是栾树根部差异表达基因主要富集部分.在地上部中,差异表达基因主要富集在膜内组分和膜部分.KEGG途径富集分析表明,在根部中核糖体(Ribosome)、吞噬体(Phagosome)和三羧酸循环(Citrate cycle(TCA cycle))是主要的富集途径.在叶中,植物激素信号转导通路显著富集.转录因子鉴定结果显示共有10种转录因子家族的基因差异表达...
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关 键 词: | 栾树(Koelreuteria paniculata) 镉胁迫 重金属 转录组测序(RNA-Seq) 差异表达基因 |
收稿时间: | 2021/8/9 0:00:00 |
修稿时间: | 2021/9/3 0:00:00 |
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