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真菌对磺胺二甲氧嘧啶降解过程的转录组分析及差异表达基因的功能分析
引用本文:张澜,刘云,陈瑞环,田坤,董元华,李忠佩.真菌对磺胺二甲氧嘧啶降解过程的转录组分析及差异表达基因的功能分析[J].环境科学学报,2021,41(4):1366-1374.
作者姓名:张澜  刘云  陈瑞环  田坤  董元华  李忠佩
作者单位:1. 中国科学院南京土壤研究所土壤环境与污染修复重点实验室, 南京 210008;2. 中国科学院大学, 北京 100000
基金项目:国家重点研发计划(No.2018YFC1803100);国家自然科学基金面上项目(No.21477137,41877504)
摘    要:采用黄孢原毛平革菌降解磺胺二甲氧嘧啶(SDM),4 d后SDM的去除率达74%,降解速率达3.24 mg·L-1·d-1.采用Illumina高通量测序平台对降解SDM后的菌株与对照组菌株进行测序,通过GO和KEGG富集分析,得到的差异表达基因能显著富集到与降解相关的“氧化还原酶活性”途径,及与应激反应有关的“ABC转运体”路径.通过对高表达高上调的差异表达基因的筛选与分析,得到了耐受和降解SDM的功能基因.水通道蛋白、ABC转运蛋白及甲基转运酶基因等在黄孢原毛平革菌对环境的耐受中起到重要的作用.乙醇氧化酶、细胞色素P450和糖苷水解酶等在黄孢原毛平革菌对SDM的降解中起着关键的作用.本文从转录组水平分析了SDM的降解机制,为黄孢原毛平革菌在环境修复中的应用提供一定的参考.

关 键 词:白腐真菌  转录组  差异表达基因  功能基因  抗生素
收稿时间:2020/6/27 0:00:00
修稿时间:2020/8/7 0:00:00
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