| 二氧化硫胁迫下拟南芥miRNA表达谱分析 |
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| 引用本文： | 李利红,仪慧兰.二氧化硫胁迫下拟南芥miRNA表达谱分析[J].环境科学学报,2019,39(7):2392-2397. |
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| 作者姓名： | 李利红 仪慧兰 |
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| 作者单位： | 晋中学院化学化工学院,晋中,030619;山西大学生命科学学院,太原,030006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（No.31371868）；高等学校博士学科点专项科研基金（No.20121401110007）；中国博士后科学基金（No.2014M551056） |
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| 摘 要： | 以拟南芥为材料,利用高通量测序技术并结合生物信息学分析方法,检测二氧化硫(SO_2)处理后拟南芥植株的小分子RNA表达谱,筛选SO_2胁迫响应microRNAs(miRNAs)分子,研究植物miRNAs对逆境胁迫的应答机制.结果发现,30 mg·m~(-3) SO_2处理72 h后,拟南芥地上组织小分子RNA长度分布发生改变,在对照组和SO_2组中均有大量特有的小分子RNA序列,说明SO_2胁迫可诱导拟南芥小分子RNA的表达改变.SO_2胁迫诱导186个保守miRNA和16个新miRNA分子差异表达,其靶基因主要涉及转录调控、信号转导、代谢、刺激响应等生理过程.差异表达的miR160和miR393可通过生长素信号途径调控植株生长发育,参与植物对SO_2的胁迫响应.本研究揭示了植物中参与SO_2胁迫应答的miRNA种类及作用机制,进一步阐明了miRNAs在植物抗逆应答过程中的作用.
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| 关 键 词： | 拟南芥 SO2 miRNA 高通量测序 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2018/12/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/2/21 0:00:00 |
Analysis of miRNA expression profiles in Arabidopsis under SO2 stress |
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| LI Lihong and YI Huilan.Analysis of miRNA expression profiles in Arabidopsis under SO2 stress[J].Acta Scientiae Circumstantiae,2019,39(7):2392-2397. |
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| Authors: | LI Lihong and YI Huilan |
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| Institution: | School of Chemistry and Chemical Engineering, Jinzhong College, Jinzhong 030619 and School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Arabidopsis SO2 miRNA deep sequencing bioinformatics |
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