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渤海湾天津沿岸海水中甲肝病毒的检测和定量
引用本文:张明露,杨健,赵宏,朱琳,赵化冰,蔡宝立.渤海湾天津沿岸海水中甲肝病毒的检测和定量[J].环境科学,2009,30(6):1608-1613.
作者姓名:张明露  杨健  赵宏  朱琳  赵化冰  蔡宝立
作者单位:1. 南开大学微生物学系,生物活性材料教育部重点实验室,天津,300071
2. 天津出入境检验检疫局,天津,300042
3. 南开大学环境科学与工程学院,天津,300071
4. 中国人民武装警察部队医学院,天津市职业与环境危害生物标志物重点实验室,天津,300162
基金项目:国家高技术研究发展计划(863)项目(2006AA09Z170)
摘    要:甲肝病毒(hepatitis A virus, HAV)是能引起传染性甲型肝炎的单链RNA病毒.用常规RT-PCR(反转录PCR)和SYBR Green实时定量RT-PCR方法,根据甲肝病毒保守的VP1-VP2基因序列设计引物,对渤海湾天津沿岸海水中的甲肝病毒进行了检测和定量分析. 9个样品取自渤海湾天津塘沽以南沿岸海水,取样时间分别是2007年夏、秋、冬季和2008年春季. 海水样品先用小型超滤装置(Millipore Pellicon Mini TFF)或超滤离心管(Millipore Centricon Plus-70)浓缩,然后进行RT-PCR检测.结果表明,从9个海水样品中都能扩增出192 bp的HAV cDNA,这些cDNA的核苷酸序列与GenBank中的同源序列相似性为95%~100%. 用SYBR Green 实时定量RT-PCR检测了春季和冬季的6个海水样品,结果表明,海水中甲肝病毒的浓度范围为5.35×106~4.51×107 virus particles/L.

关 键 词:海水  甲肝病毒  RT-PCR  实时定量RT-PCR
收稿时间:7/7/2008 12:00:00 AM
修稿时间:2008/9/16 0:00:00

Detection and Quantification of Hepatitis A Virus in Tianjin Coastal Seawater of Bohai Bay
ZHANG Ming-lu,YANG Jian,ZHAO Hong,ZHU Lin,ZHAO Hua-bing and CAI Bao-li.Detection and Quantification of Hepatitis A Virus in Tianjin Coastal Seawater of Bohai Bay[J].Chinese Journal of Environmental Science,2009,30(6):1608-1613.
Authors:ZHANG Ming-lu  YANG Jian  ZHAO Hong  ZHU Lin  ZHAO Hua-bing and CAI Bao-li
Abstract:Hepatitis A virus(HAV) is single-strainded RNA virus that causes infectious hepatitis A.Detection and quantification of hepatitis A virus in Tianjin coastal seawater of Bohai Bay were carried out by conventional RT-PCR and SYBR Green real-time quantitative RT-PCR using the primers based on the conserved sequence at the VP1-VP2 genes of HAV.The nine samples were taken at Tianjin coastal seawater of Bohai Bay locating in the south of Tanggu,in summer,autumn and winter of 2007 and spring of 2008.For viral dete...
Keywords:seawater  hepatitis A virus  RT-PCR  real-time quantitative RT-PCR
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