| 海洋沉积物中硫酸盐还原菌和硫氧化菌群落分析方法的比较 |
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| 引用本文： | 张玉,米铁柱,甄毓,陈烨,付璐璐,王勋功.海洋沉积物中硫酸盐还原菌和硫氧化菌群落分析方法的比较[J].环境科学,2018,39(1):438-449. |
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| 作者姓名： | 张玉 米铁柱 甄毓 陈烨 付璐璐 王勋功 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100;海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100;海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100;海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071;中国海洋大学海洋生命学院, 青岛 266003,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071;中国海洋大学海洋生命学院, 青岛 266003,中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100;海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（41521064，41620104001）；中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室项目；青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学开放基金项目（KLMEES201601） |
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| 摘 要： | 硫酸盐还原菌(sulfate-reducing prokaryotes,SRP)和硫氧化菌(sulfur-oxidizing prokaryotes,SOP)在硫的生物地球化学循环中发挥着极为重要的作用.本文以SRP作为高丰富度高多样性菌群代表,针对于SRP所共有的异化型亚硫酸盐还原酶(dissimilatory sulphite reductase,DSR)中的β亚基基因(dsr B),通过克隆文库技术、454高通量测序技术和Illumina高通量测序技术对其群落特征进行比较分析.结果表明,Illumina高通量测序技术优于454高通量测序技术和克隆文库技术,特别在低丰度物种的检测方面,Illumina高通量测序技术具有明显优势.以SOP soxB基因(~750 bp)作为较长基因片段的代表,分别采用454高通量测序技术和Illumina单端高通量测序技术对SOP群落组成和多样性信息进行比较分析,结果表明,454高通量测序技术在读长上的优势并未体现出来,而Illumina单端高通量测序技术优于454高通量测序技术.
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| 关 键 词： | 硫酸盐还原菌 硫氧化菌 高通量测序 克隆文库 沉积物 |
| 收稿时间： | 2017/5/7 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/7/20 0:00:00 |
Analysis of Sulfate-Reducing and Sulfur-Oxidizing Prokaryote Community Structures in Marine Sediments with Different Sequencing Technologies |
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| ZHANG Yu,MI Tie-zhu,ZHEN Yu,CHEN Ye,FU Lu-lu and WANG Xun-gong.Analysis of Sulfate-Reducing and Sulfur-Oxidizing Prokaryote Community Structures in Marine Sediments with Different Sequencing Technologies[J].Chinese Journal of Environmental Science,2018,39(1):438-449. |
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| Authors: | ZHANG Yu MI Tie-zhu ZHEN Yu CHEN Ye FU Lu-lu and WANG Xun-gong |
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| Institution: | College of Environmental Science and Engineering, Ocean University of China, Qingdao 266100, China;Key Laboratory of Marine Environment and Ecology, Ministry of Education, Qingdao 266100, China;Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China,College of Environmental Science and Engineering, Ocean University of China, Qingdao 266100, China;Key Laboratory of Marine Environment and Ecology, Ministry of Education, Qingdao 266100, China;Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China,College of Environmental Science and Engineering, Ocean University of China, Qingdao 266100, China;Key Laboratory of Marine Environment and Ecology, Ministry of Education, Qingdao 266100, China;Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China,Key Laboratory of Marine Environment and Ecology, Ministry of Education, Qingdao 266100, China;Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China;College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China,Key Laboratory of Marine Environment and Ecology, Ministry of Education, Qingdao 266100, China;Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China;College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China and College of Environmental Science and Engineering, Ocean University of China, Qingdao 266100, China;Key Laboratory of Marine Environment and Ecology, Ministry of Education, Qingdao 266100, China;Laboratory for Marine Ecology and Environmental Science, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sulfate-reducing prokaryotes (SRP) sulfur-oxidizing prokaryotes (SOP) high-throughput sequencing clone library sediments |
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