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基于分子技术的1株产毒藻藻际细菌多样性分析
引用本文:杨小茹,苏建强,郑小伟,周月霞,田蕴,宁修仁,郑天凌.基于分子技术的1株产毒藻藻际细菌多样性分析[J].环境科学,2009,30(1):271-279.
作者姓名:杨小茹  苏建强  郑小伟  周月霞  田蕴  宁修仁  郑天凌
作者单位:1. 厦门大学生命科学学院,滨海湿地生态系统教育部重点实验室,厦门,361005;厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室,厦门,361005
2. 厦门大学生命科学学院,滨海湿地生态系统教育部重点实验室,厦门,361005
3. 国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室,杭州,310012
4. 厦门大学生命科学学院,滨海湿地生态系统教育部重点实验室,厦门,361005;厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室,厦门,361005;国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室,杭州,310012
基金项目:国家高技术研究发展计划(863)项目 (2008AA09Z408);长江学者和创新团队发展计划项目(40521003);国家重点基础研究发展规划(973)项目(2006CB400605);国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室开放基金项目(LMEB200601);教育部博士点专项基金项目(20050384002);中国博士后科学基金项目
摘    要:采用构建16S rDNA克隆文库的方法,对实验室保存的1株产毒塔玛亚历山大藻在不同时期的藻际细菌群落多样性进行了分析.限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)结果表明,塔玛亚历山大藻藻际微生物的16S rDNA克隆文库中的克隆子总共可分为 34 种基因型,选取各谱型的代表克隆子测定其16S rDNA片段核苷酸序列,将所获得的序列与GenBank数据库进行BLAST比对,结果表明所有基因型分属于2个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes).在延滞期的藻培养液中,α-Proteobacteria占36.4%,β-Proteobacteria占9.1%,γ-Proteobacteria占27.3%,拟杆菌门(Bacteroidetes)占27.3%;在指数后期的培养液中,α-Proteobacteria占53.3%,β-Proteobacteria占13.3%,γ-Proteobacteria占6.7%,拟杆菌门(Bacteroidetes)占26.7%; 在稳定期的培养液中,α-Proteobacteria占47.8%,β-Proteobacteria占8.7%,γ-Proteobacteria占21.7%,δ-Proteobacteria占4.3%,拟杆菌门(Bacteroidetes)占17.4%;其中有不少克隆子与已知序列同源性低于 94%,表明塔玛亚历山大藻藻际环境中附着有新的未开发的微生物资源,这些细菌可能在微藻的生消过程中起着重要的调控作用,所以本研究结果在赤潮微生物调控中具有重要的理论意义和应用价值.

关 键 词:塔玛亚历山大藻  藻际  rDNA克隆文库  细菌多样性
收稿时间:2008/5/21 0:00:00
修稿时间:2008/7/11 0:00:00

16S rDNA Clone Library Analysis of Microbial Diversity Associated with the PSP-producing Dinoflagellate Alexandrium tamarense
YANG Xiao-ru,SU Jian-qiang,ZHENG Xiao-wei,ZHOU Yue-xi,TIAN Yun,NING Xiu-ren and ZHENG Tian-ling.16S rDNA Clone Library Analysis of Microbial Diversity Associated with the PSP-producing Dinoflagellate Alexandrium tamarense[J].Chinese Journal of Environmental Science,2009,30(1):271-279.
Authors:YANG Xiao-ru  SU Jian-qiang  ZHENG Xiao-wei  ZHOU Yue-xi  TIAN Yun  NING Xiu-ren and ZHENG Tian-ling
Abstract:The composition of bacterial community in the Alexandrium tamarense culture was determined by analyzing the 16S rDNA clone libraries.16S rRNA gene was amplified by using the total DNA extracted from the A.tamarense culture at three growth stages as templates.34 different restriction fragment length polymorphism(RFLP) patterns of the clones were obtained from the three libraries.Clones representing each RFLP patterns were sequenced and phylogenetic analysis revealed that the Proteobacteria and the Bacteroide...
Keywords:16S
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