| 基于多个扩增子的DNA metabarcoding技术探究黄海微型真核浮游植物多样性 |
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| 引用本文： | 张莉,张远,林佳宁,王书平.基于多个扩增子的DNA metabarcoding技术探究黄海微型真核浮游植物多样性[J].环境科学,2019,40(9):4052-4060. |
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| 作者姓名： | 张莉 张远 林佳宁 王书平 |
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| 作者单位： | 中国环境科学研究院河流生态保护与修复研究室, 北京 100012;中国科学院生态环境研究中心, 北京 100085;中国科学院大学, 北京 100049,中国环境科学研究院河流生态保护与修复研究室, 北京 100012,中国环境科学研究院河流生态保护与修复研究室, 北京 100012,中国环境科学研究院河流生态保护与修复研究室, 北京 100012 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（41571050） |
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| 摘 要： | 微型真核浮游植物是海洋生态系统中能量流动和物质循环的关键环节,对维持海洋生态系统的稳定发挥着关键的作用.本研究首次应用DNA metabarcoding技术探讨黄海微型真核浮游植物的物种组成及多样性,对比分析ITS、18S r DNA V4和18S r DNA V9扩增子条件下微型真核浮游植物的群落结构及多样性水平,并探讨了其多样性与温度、盐度的响应关系.结果表明:①基于ITS扩增子获得的微型真核浮游植物中绿藻门所占比例较高,而基于18S r DNA V4和18S r DNA V9扩增子获得的甲藻门相对丰度较高.②基于18S r DNA V9扩增子获得的微型真核浮游植物的ACE、Chao1、Shannon和Simpson指数较ITS和18S r DNA V4扩增子更高,而且其门、纲、目和科的数目较高.③黄海微型真核浮游植物的Shannon指数与温度呈现出显著正相关的关系(P 0. 01),而与盐度呈现出显著负相关的关系(P 0. 05).本研究通过对比不同扩增子条件下黄海微型真核浮游植物的群落结构及丰度特征,丰富了黄海微型真核浮游植物的认识,可为今后该海域微型真核浮游植物的生态学研究、生物多样性监测、生物资源动态变化及持续开发生产等方面的分析提供科学依据.
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| 关 键 词： | 微型真核浮游植物 DNA metabarcoding ITS 18S rDNA V4 18S rDNA V9 多样性 |
| 收稿时间： | 2018/11/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/3/22 0:00:00 |
Community Diversity of Eukaryotic Nano-phytoplankton in Yellow Sea Using DNA Metabarcoding Technology Based on Multiple Amplicons |
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| ZHANG Li,ZHANG Yuan,LIN Jia-ning and WANG Shu-ping.Community Diversity of Eukaryotic Nano-phytoplankton in Yellow Sea Using DNA Metabarcoding Technology Based on Multiple Amplicons[J].Chinese Journal of Environmental Science,2019,40(9):4052-4060. |
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| Authors: | ZHANG Li ZHANG Yuan LIN Jia-ning and WANG Shu-ping |
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| Institution: | Laboratory of Riverine Ecological Conservation and Technology, Chinese Research Academy of Environmental Sciences, Beijing 100012, China;Research Center for Eco-Environmental Sciences, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100085, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Laboratory of Riverine Ecological Conservation and Technology, Chinese Research Academy of Environmental Sciences, Beijing 100012, China,Laboratory of Riverine Ecological Conservation and Technology, Chinese Research Academy of Environmental Sciences, Beijing 100012, China and Laboratory of Riverine Ecological Conservation and Technology, Chinese Research Academy of Environmental Sciences, Beijing 100012, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | eukaryotic nano-phytoplankton DNA metabarcoding ITS 18S rDNA V4 18S rDNA V9 biodiversity |
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