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北戴河近岸沉积物中微生物16SrDNA的PCR—RFLP分析
引用本文:樊景凤,张兰,明红霞,陈立广,吴利军,林凤翱,陈吉平.北戴河近岸沉积物中微生物16SrDNA的PCR—RFLP分析[J].海洋环境科学,2008,27(5).
作者姓名:樊景凤  张兰  明红霞  陈立广  吴利军  林凤翱  陈吉平
作者单位:1. 中国科学院大连化学物理研究所,辽宁,大连,116023;国家海洋环境监测中心,辽宁,大连,116023
2. 国家海洋环境监测中心,辽宁,大连,116023;大连水产学院,生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023
3. 国家海洋环境监测中心,辽宁,大连,116023
4. 中国科学院大连化学物理研究所,辽宁,大连,116023
摘    要:采用间接法提取了北戴河地区近岸沉积物中微生物的总DNA,以细菌的通用引物27F和1492R扩增16S rDNA片段,将扩增产物克隆到T-载体上,并转化大肠杆菌感受态细胞,构建沉积物中细菌16S rDNA克隆文库.PCR扩增基因文库中插入的16S rDNA外源片段,用两种限制性内切酶Hha Ⅰ和Rsa Ⅰ分别酶切,获得该海洋沉积物131个克隆的酶切指纹图谱.结果表明:HhaⅠ和Rsa Ⅰ联合酶切产生了41个基因分型,文库的覆盖度达74.81%,Hha Ⅰ和Rsa Ⅰ单酶切产生的基因分型分别为30和22,但文库的覆盖度高:克隆文库中存在一种优势类群,占总克隆的23%.16S rDNA测序结果表明:北戴河近岸沉积物中的细菌在分类方面主要属于α-和γ-变形杆菌亚门.

关 键 词:沉积物中微生物  间接提取法  16S  rDNA克隆文库  RFLP分析

PCR-RFLP analysis of bacteria 16S rDNA in marine sediment of Beidaihe
FAN Jing-feng,ZHANG Lan,MING Hong-xia,CHEN Li-guang,WU Ling-jun,LIN Feng-ao,Chen Ji-ping.PCR-RFLP analysis of bacteria 16S rDNA in marine sediment of Beidaihe[J].Marine Environmental Science,2008,27(5).
Authors:FAN Jing-feng  ZHANG Lan  MING Hong-xia  CHEN Li-guang  WU Ling-jun  LIN Feng-ao  Chen Ji-ping
Abstract:
Keywords:
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