| 入侵植物小蓬草的细菌群落组成和多样性研究 |
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| 引用本文： | 程丹丹,赵菁,田忠赛.入侵植物小蓬草的细菌群落组成和多样性研究[J].安全与环境工程,2019,26(2):16-24. |
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| 作者姓名： | 程丹丹 赵菁 田忠赛 |
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| 作者单位： | 中国地质大学(武汉)环境学院,湖北武汉,430074;中国地质大学(武汉)环境学院,湖北武汉,430074;中国地质大学(武汉)环境学院,湖北武汉,430074 |
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| 摘 要： | 生物入侵现象严重危害生态系统的健康,其中外来植物入侵是生物入侵中的重要组成,会对农业、林业、畜牧业产生直接的经济危害。选取生长状况良好的菊科外来入侵植物小蓬草(Conyza canadensis L.,Asteraceae)植株,利用16S rRNA基因的高通量测序技术和后续分析,探索小蓬草生境中的土壤及其根和叶的细菌群落组成和多样性,并分析表面消毒、冷冻干燥保存和不同研磨方法等处理方式对研究结果的影响。结果表明:小蓬草根样本细菌群落中OTU的数目最多,其次是土壤,小蓬草叶样本的细菌群落中OTU的数目最低;小蓬草细菌群落Alpha多样性在土壤样本中最高,其次是小蓬草根,小蓬草叶的细菌群落Alpha多样性最低;在门的水平,在土壤和小蓬草叶、根的细菌群落均以变形菌门和放线菌门丰度最高,此外在小蓬草根和叶的细菌群落丰度较高的还有厚壁菌门,在土壤细菌群落丰度较高的则是拟杆菌门;小蓬草根和叶细菌群落的优势属包括假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)、甲基杆菌属(Methylobacterium)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、根瘤菌属(Rhizobium)和无色杆菌属(Achromobacter)等,这些优势属可能包含植物益生菌,并对小蓬草适应不良环境提供一定的帮助;是否进行表面消毒处理的小蓬草叶和根样本的细菌群落组成和多样性有明显的差异,表明小蓬草的根表和根内以及叶表和叶内的细菌群落存在明显的差异;机器研磨、冷冻干燥保存处理的小蓬草样本与人工研磨并及时处理的小蓬草样本相比,其细菌群落组成并没有明显的差异,表明这些处理方式对植物微生物组的研究结果不会产生明显的影响。该研究结果可为微生物在植物入侵机制中所起的作用提供数据支持。
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| 关 键 词： | 小蓬草 外来入侵植物 植物微生物组 细菌群落组成 Alpha多样性 16S RRNA基因 高通量测序 |
Composition and Diversity of Bacterial Community of the Alien Invasive Plant (Conyza canadensis L.) |
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| CHENG Dandan,ZHAO Jing,TIAN Zhongsai.Composition and Diversity of Bacterial Community of the Alien Invasive Plant (Conyza canadensis L.)[J].Safety and Environmental Engineering,2019,26(2):16-24. |
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| Authors: | CHENG Dandan ZHAO Jing TIAN Zhongsai |
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| Institution: | (School of Environmental Studies,China University of Geosciences (Wuhan),Wuhan 430074,China) |
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| Abstract: | CHENG Dandan;ZHAO Jing;TIAN Zhongsai(School of Environmental Studies,China University of Geosciences (Wuhan),Wuhan 430074,China) |
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| Keywords: | Conyza Canadensis L alien invasive plant plant microbiota/microbiome composition of bacterial community Alpha diversity 16S rRNA gene high throughput sequencing |
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