| 一种羟胺氧化酶基因序列的PCR扩增及其生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 赵祖国,孔庆鑫,王景峰,金敏,王新为,李君文.一种羟胺氧化酶基因序列的PCR扩增及其生物信息学分析[J].应用与环境生物学报,2009,15(1). |
| |
| 作者姓名： | 赵祖国 孔庆鑫 王景峰 金敏 王新为 李君文 |
| |
| 作者单位： | 中国人民解放军军事医学科学院卫生学与环境医学研究所,天津,300050 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划)，天津市应用基础研究计划 |
| |
| 摘 要： | 采用PCR法获得不动杆菌Acinetobactor sp.YY-5的一种羟胺氧化酶(Hydroxylamine oxidoreductase,HAO)编码基因序列并进行生物信息学分析.根据自养菌的HAO基因序列保守区设计4对引物,通过RT-PCR获得预期大小的部分序列,再采用Genome walking PCR法向所得的部分序列两侧延伸;对所得序列在NCBI中进行blast分析,并用FGeneSB进行开放滨码框(Open read frame,ORF)预测.结果表明,RT-PCR获得了一段462 bp的序列,通过Genome walking PCR向两侧延伸后,获得了一段3 152 bp长的序列;ORF预测结果显示所得序列可能有4个ORF,RT-PCR获得的462 bp序列所在ORF长555 bp,对应氨基酸序列相对分子质量(M)大小为20.2×103;在Genebank中进行的Blast比对分析显示,除保守区的引物序列外,未发现有与此ORF存在明显相似性的HAO基因,表明这可能是一种新型羟胺氧化酶基因.图5表3参14
|
| 关 键 词： | 不动杆菌 生物信息学 生物脱氮 氨氮 羟胺氧化酶 基因序列 开放读码框 |
PCR Amplification and Bioinformatics of a Novel Gene Coding Hydroxylamine Oxidoreductase |
| |
| ZHAO Zuguo,KONG Qingxin,WANG Jingfeng,JIN Min,WANG Xinwei,LI Junwen.PCR Amplification and Bioinformatics of a Novel Gene Coding Hydroxylamine Oxidoreductase[J].Chinese Journal of Applied and Environmental Biology,2009,15(1). |
| |
| Authors: | ZHAO Zuguo KONG Qingxin WANG Jingfeng JIN Min WANG Xinwei LI Junwen |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | PCR |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
