| 基于多花黄精转录组的HIPPs/HPPs基因家族鉴定与表达调控 |
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| 引用本文： | 李小利,朱田圆,班景洁,王庆爽,陈翠蓉,张慧,朱建明,叶炜,赖钟雄,林玉玲,陈裕坤.基于多花黄精转录组的HIPPs/HPPs基因家族鉴定与表达调控[J].应用与环境生物学报,2024(1):133-143. |
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| 作者姓名： | 李小利 朱田圆 班景洁 王庆爽 陈翠蓉 张慧 朱建明 叶炜 赖钟雄 林玉玲 陈裕坤 |
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| 作者单位： | 1. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;2. 现代设施农业福建省高等学校工程研究中心;3. 福建金湖源生态农业有限公司;4. 三明市农业科学研究院药用植物研究所 |
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| 摘 要： | PcHIPPs/PcHPPs是一类细胞内可溶性金属结合蛋白，在调节植物重金属稳态、解毒机制、重金属耐受等方面发挥重要作用，目前关于HIPPs/HPPs基因家族在多花黄精中还未有人研究.基于多花黄精不同转录组数据，采用生物信息学进行理化性质分析、亚细胞定位和保守基序及系统进化树分析，并对其功能进行初步分析，研究HIPPs/HPPs基因在不同铅处理下的表达情况.结果表明：从多花黄精中鉴定出68个PcHIPPs和43个PcHPPs基因；PcHIPPs基因家族的氨基酸数为134-501，分子量介于15.53-53.09 ku之间，等电点介于5.12-9.88;PcHPPs基因的氨基酸数为101-352，分子量介于11.46-38.23 ku，等电点介于5.58-10.41；亚细胞定位预测表明，PcHIPPs/PcHPPs基因有73个分布在细胞核内；通过KEGG分析发现PcHPP3、PcHIPP28-5、PcHIPP28-6、PcHPP1-5参与到代谢过程；PcHIPPs/PcHPPs基因在多花黄精根状茎中主要发挥作用，在盐胁迫处理48 h下大部分PcHIPPs/PcHPPs基因表现出明显的下调...
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| 关 键 词： | 多花黄精 HIPPs基因 HPPs基因 生物信息学分析 表达分析 |
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