| 红球菌酰胺酶降解阴离子型聚丙烯酰胺的亲和力分析 |
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| 引用本文： | 王方略,张东晨,吴学凤,邓胜松,袁新宇.红球菌酰胺酶降解阴离子型聚丙烯酰胺的亲和力分析[J].环境化学,2023(1):319-326. |
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| 作者姓名： | 王方略 张东晨 吴学凤 邓胜松 袁新宇 |
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| 作者单位： | 1. 安徽理工大学材料科学与工程学院;2. 合肥工业大学食品与生物工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(51274012)资助~~； |
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| 摘 要： | 为探究酰胺酶降解阴离子型聚丙烯酰胺（HPAM）的微观机理，采用分子对接分别模拟了阴离子型聚丙烯酰胺（HPAM）或聚丙烯酸酯（PAA）结构模型与Rhodococcus sp. N-771酰胺酶（Rh Amidase）的结合，根据-CDOCKER＿Energy score值最高的原则，对获得最佳结合构象进行分析.基于亲和力虚拟突变进行丙氨酸（ALA）扫描.亲和力分析表明，Rh Amidase对HPAM-2的亲和力最高、最稳定，而Rh Amidase于PAA-2相互作用最小、结合最好.同时，该酶更倾向于降解短链的聚合物.相互作用分析表明，疏水相互作用是Rh Amidase-HPAM-2比Rh Amidase-PAA-2更稳定的主要原因.通过ALA扫描进一步得知，PHE146、ILE450、LYS96和GLY193是Rh Amidase降解HPAM-2的关键氨基酸残基.其中GLY193与HPAM-2形成的1个氢键对Rh Amidase-HPAM-2的亲和力影响最大.突变体ASP191ALA可以提高Rh Amidase对HPAM-2的酶活性，这些数据可为设计更高活性的Rh Amidase突变体提...
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| 关 键 词： | 酰胺酶 阴离子型聚丙烯酰胺(HPAM) 分子对接 丙氨酸(ALA)扫描 |
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