| BPA暴露对本体和子代胰岛β细胞转录组差异对比分析 |
| |
| 引用本文： | 姬晓彤, 岳慧峰, 武美琼, 白剑英. BPA暴露对本体和子代胰岛β细胞转录组差异对比分析[J]. 环境化学, 2021, (2): 509-519. doi: 10.7524/j.issn.0254-6108.2020101306 |
| |
| 作者姓名： | 姬晓彤 岳慧峰 武美琼 白剑英 |
| |
| 作者单位： | 1. 山西医科大学公共卫生学院环境卫生教研室, 太原, 030001;;; 2. 山西大学环境与资源学院环境健康研究中心, 太原, 030006 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(21906099);山西省教育厅高校科技创新项目(2020L0174,2020L0025);山西省自然科学基金(201701D121140)资助。 |
| |
| 摘 要： | 双酚A （BPA）作为一种典型的环境内分泌干扰物,与二型糖尿病和肥胖症等代谢类疾病密切相关.在这项研究中,旨在探讨BPA直接暴露以及围产期暴露对本体和子代胰岛β细胞影响的差异,从而实现对不同易感人群的精准预防与治疗.通过对GEO数据库中GSE126297和GSE82175两个数据集进行分析,共筛选出108个共有的差异基因,其中28个表达趋势一致,而另外80个表达趋势相反.随后对本体和子代单独的差异基因,以及共有差异基因进行了GO和KEGG对比分析.此外,利用String数据库和Cytoscape分析PPI网络中的紧密联系的基因,并将其可视化,进一步从28个表达趋势一致的基因中筛选出相互作用最为紧密的基因集1（Iqgap2,Igf2r和Rab18）;从80个表达趋势相反的基因中筛选出相互作用紧密的基因集2（Polr2f,Ccnt2,Polr2e,Kdm7a,Fbl）和基因集3（Atp5g2,Atp5o和Ndufa6）.最后,通过GEPIA在线验证上述基因在胰腺癌样本中的表达,研究发现Rab18,Polr2f,Polr2e,Fbl,Atp5g2,Atp5o和Ndufa6在胰腺癌病例中的表达均显著上升.同时,上述基因在本体中呈现显著上升趋势,而对于子代,只有Rab18显著上升,其他基因则呈下降趋势.综上,BPA对本体和子代的影响有一定的关联,其中关联的关键基因的异常表达可能会增加本体罹患胰腺癌的风险,而对于子代则会影响代谢过程和细胞结构.
|
| 关 键 词： | 双酚A(BPA) 本体子代 胰岛β细胞 生信分析 |
| 收稿时间： | 2020-10-13 |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《环境化学》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《环境化学》下载免费的PDF全文 |
|
