| 红球菌酰胺酶降解阴离子型聚丙烯酰胺的亲和力分析 |
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| 引用本文： | 王方略, 张东晨, 吴学凤, 邓胜松, 袁新宇. 红球菌酰胺酶降解阴离子型聚丙烯酰胺的亲和力分析[J]. 环境化学, 2023, 42(1): 319-326. doi: 10.7524/j.issn.0254-6108.2021083103 |
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| 作者姓名： | 王方略 张东晨 吴学凤 邓胜松 袁新宇 |
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| 作者单位： | 1.安徽理工大学材料科学与工程学院,淮南,232001;; 2.合肥工业大学食品与生物工程学院,合肥,230009 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(51274012)资助~~; |
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| 摘 要： | 
为探究酰胺酶降解阴离子型聚丙烯酰胺（HPAM）的微观机理,采用分子对接分别模拟了阴离子型聚丙烯酰胺（HPAM）或聚丙烯酸酯（PAA）结构模型与Rhodococcus sp. N-771酰胺酶（Rh Amidase）的结合,根据-CDOCKER ˍ Energy score值最高的原则,对获得最佳结合构象进行分析。基于亲和力虚拟突变进行丙氨酸（ALA）扫描。亲和力分析表明,Rh Amidase对HPAM-2的亲和力最高、最稳定,而Rh Amidase于PAA-2相互作用最小、结合最好。同时,该酶更倾向于降解短链的聚合物。
相互作用分析表明,疏水相互作用是Rh Amidase-HPAM-2比Rh Amidase-PAA-2更稳定的主要原因。通过ALA扫描进一步得知,PHE146、ILE450、LYS96和GLY193是Rh Amidase降解HPAM-2的关键氨基酸残基。其中 GLY193与HPAM-2形成的1个氢键对Rh Amidase-HPAM-2的亲和力影响最大。突变体ASP191ALA可以提高Rh Amidase对HPAM-2的酶活性,这些数据可为设计更高活性的Rh Amidase突变体提供理论指导。
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| 关 键 词： | 酰胺酶 阴离子型聚丙烯酰胺(HPAM) 分子对接 丙氨酸(ALA)扫描 |
| 收稿时间： | 2021-08-31 |
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