慢生型花生根瘤菌16S rRNA分析

以２１株分离自四川,云南不同花生产区的慢性型花生根瘤菌和６株参比菌株为材料,进行了１６ＳｒＤＮＡＰＣＲ－ＲＦＬＰ,结果除证实了慢性型花生根瘤菌同慢生型大豆根瘤菌（Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉｕｍｊａｐｏｎｉｃｕｍ）高度的遗传相似性外,还发现了一些菌株同Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｉｂｉｕｍｌｉａｏｎｉｎｇｅｎｓｉｓ和Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉｕｍｅｌｋａｎｉｉ有较高的遗传相似性,菌株Ｓｐｒ１－２的１６ＳｒＲＮＡ     

慢生花生根瘤菌的遗传多样性研究

用ＲＥＰ１Ｒ１和ＲＥＰ２１ＤＮＡ为引物,对２２株四川土著慢生花生根瘤菌染色体ＤＮＡ的基因外回文重复序列（ＲｅｐｅｔｉｔｉｖｅＥｘｔｒｏｇｅｎｉｃｐａｌｉｎｄｒｏｍｉｃｓｅｑｕｅｎｃｅＲＥＰ）进行了ＰＣＲ扩增和凝胶电泳,并对电泳结果的指纹图型进行了相似性聚类分析．结果表明了四川土著慢生花生根瘤菌的遗传多样性．指纹图形是根瘤菌多样性研究中一种简便而有效的方法     

慢生型大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)聚羟丁酸合成酶基因(phbC)突变体的构建及其特性

通过转座子Tn5诱变和同源重组，构建了Bradyrhizobium japonicum USDA110聚羟丁酸合成酶基因(phbC)突变体．序列测定确定了转座子插入的精确位置，所获得的4个转座子诱变的质粒其Tn5插在phbC基因内两个相距仅9bp的位点．被Southern和PCR证实的突变体菌株仍能产生相当于野生型菌株12．97％—25．10％的PHB，并且在突变体和野生型菌株总DNA杂交图上都呈现出一条约5kb的阳性带，推测在B.japonicum基因组中存在不止一个聚羟丁酸合成酶基因．图3表4参17     

慢生根瘤菌交叉结瘤及其系统发育关系的研究

选用包括6株花往根瘤菌[Bradyrhizobium sp.(Arachis)]在内的13株慢生根瘤菌，进行了6种豆科植物结瘤试验及共系统发育分析。研究结果表明，慢生根瘤菌与试验的豆科宿主植物间普遍存在交叉结瘤，还发现有些菌株在原宿主外的豆科植物根部形成类根瘤的现象。16S rDNA和23S rDNA的PCR－RFLP分析揭示出这些菌株rDNA基因的差异性，不同宿主来源的慢生根瘤菌株可以同属一个rDNA类型，而从同一宿主中分离的根瘤菌菌株可分属多种不同的rDNA类型，研究结果表明，采用rDNA PCR-RFLP等遗传背景分析的手段，可能筛选出广谱的根瘤菌力株，表4参8。     

慢生大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)聚羟丁酸合成酶基因(phbC)的克隆和序列测定

以苜蓿根瘤菌Rm1021的phaC基因突变体菌株Rm11144 (phaCTn5-233)为受体菌,通过功能互补,成功地从构建的Bradyrhizobium japonicum USDA110基因文库中,筛查到能与Rm11144互补,使之恢复在以乙酰乙酸为唯一碳源的M9培养基(M9-AA)平板上5 d形成明显可见菌落,以及在MOPS平板上形成粘液型菌落的表型的重组粘粒pDC2; 经证实,该粘粒带有phbC基因.完成了该基因的全序列测定并已在GenBank登记,登记号为AY077580.B.japonicum phbC基因由1803碱基对组成,GC含量61.8%,AT含量38.2%;编码600个氨基酸,Mr=66.95×103. 图3 表3 参13     

用celB基因检测慢生花生根瘤菌竞争性的可行性

采用大肠杆菌和根瘤菌接合的方法，将celB标记基因分别导入了两株慢生型花生根瘤菌Spr3-5和Spr4-5中，对出发菌株和标记菌株的代时测定结果表明，二者之间没有显著差异．在标记菌株与出发菌株等量接种的前提下，比较了二者的竞争结瘤能力；结果显示，标记菌株形成的根瘤（蓝瘤）的占瘤率与50％相比，差异不显著，为了研究标记菌株与出发菌株的固氮有效性，测定了标记菌株与出发菌株各自共生植株的干重、全氮和叶绿素含量；结果表明，标记菌株与出发菌株的这3项指标之间没有显著差异．说明利用celB基因研究慢生花生根瘤菌的竞争结瘤能力是可行的，表5参7     

快生型大豆根瘤菌（Rhizobium fredii）内源质粒在培养及共…

以湖北洪湖分离的快生型大豆根瘤菌为材料，考察了它们的内源质粒在培养过程及共生的稳定性，结果表明，所有供试菌株的质粒在培养条件下比较稳定，传代５０次后没有明显变异。对其中２个菌株与４种不同的大豆宿主共生过程中质粒的稳定性研究，发现ＨＡ１２－１－１２的共生质粒和隐性质粒高度稳定，ＨＡ７－２－２的质粒却发生了不同程度的变异，质粒检测的结果及ＲＦＬＰ分析表明，ＨＡ７－２－２共生质粒的稳定性高于隐性质粒，而     

快生型大豆根瘤菌(Rhizobium fredii)内源质粒在培养及共生过程中的稳定性

以湖北洪湖公离的快生型大豆根瘤菌为材料，考察了它们的内源质粒在培养过程及共生过程中的稳定性．结果表明，所有供试菌株的质粒在培养条件下比较稳定，传代50次后没有明显变异．对其中2个菌株与4种不同的大豆宿主共生过程中质粒的稳定性研究，发现HA12－1－12的共生质粒和隐性质粒高度构定，HA7－2－2的质粒却发生了不同程度的变异．质粒检测的结果及RFLP分析表明，HA7－2－2共生质粒的稳定性高于隐性质粒，而且共生质粒上携带的nodDABC和nifHDK基因相当保守，不易受宿主的影响而产生变异．盆栽试验的结果也说明，虽然HA7－2－2的内源质粒在共生过程中发生了遗传重排，但它的共生性状没有明显的变异．     

潍坊、花园口土样中土著大豆根瘤菌的遗传多样性研究

采用１６Ｓ－２３Ｓ ｒＤＮＡ间隔区段（ＩＧＳ）ＲＦＬＰ分析和ＰＡＰＤ分析技术,分别对分离自山东潍坊和河南郑州花园口的２４株土著大豆根瘤菌进行２多样性分析。结果一 ７０％的相似性水平上,依ＩＧＳ－ＲＦＬＰ分析可将供试菌株分为１０群,依ＲＡＰＤ分析可将供试菌株分为８群。综合两种分析技术在５０５的相似性水平上将供试菌株分为潍坊群和花园口群。 在系统发育和分子进行上有明显的地理分隔作用。     

根瘤菌的遗传多样性与系统发育研究进展

根瘤菌 (ｒｈｉｚｏｂｉａ)是一类广泛分布于土壤中的革兰氏阴性细菌。它可以侵染豆科植物根部或茎部形成根瘤和少数茎瘤 ,固定空气中的分子态氮形成氨 ,为植物提供氮素营养 .据估计 ,全球每年生物固氮量达 1.75× 10 8ｔ,为世界工业氮肥产量的4 .37倍[1] .根瘤菌与豆科植物的共生固氮作用是生物固氮中固氮效率最高的体系 .因此 ,根瘤菌与豆科植物的共生固氮作用是实现农业可持续发展的重大研究课题之一 .研究根瘤菌的遗传多样性 ,对于发掘新的根瘤菌种质资源 ,保藏并合理利用根瘤菌基因资源库 ,选育高效菌株直接应用于农业生产有重要意义 .…     

La对Pb伤害大豆幼苗的影响

以盆载法研究了Ｐｂ对大豆幼苗的伤害及Ｌａ对Ｐｂ伤害的生态生理效应．结果显示,１０００ｍｇＬ－１ＰｂＡｃ２能严重抑制大豆幼苗代谢与生长,叶面喷布３０ｍｇＬ－１ＬａＣｌ３１次,能减轻Ｐｂ造成的毒害．实验证明,此与Ｌａ能增加大豆幼苗光合速率,提高叶绿素含量与硝酸还原酶活性,降低细胞质膜透性与体内Ｐｂ含量,维持ＴＴＣ还原力等多种作用相关     

链格孢菌菌株致病性及其遗传差异性

对分离自紫茎泽兰的19个链格孢菌菌株的致病性进行了比较研究，并对这19个菌株和其它来源的3个菌株的5．8S rDNA及其两侧的ITS1区和ITS2区进行了序列分析．结果显示，链格孢菌菌株的致病性差异明显；21株链格孢菌菌株在5．8SrDNA及其两侧的转录问区（ITS区）的序列无差异，而与百日草链格孢菌（Alternaria zinnine）的序列差异显著，表明21株链格孢菌菌株属种内变异．采用AFLP分子标记技术对21株链格孢菌的DNA扩增片段长度多态性进行了分析，结果表明，链格孢菌自然变异群体内存在很高的遗传多样性．链格孢菌菌株的相似性与菌株的地理来源有一定的相关性，但基于AFLP标记划分的AFLP类群与基于寄主病情指数划分的致病力类群问关系不相一致；起始菌株与变异菌株相似性显著，但二者和致病性的关系不显著．图2表1参18     

侵染大豆的蚕豆萎蔫病毒研究

从杭州市郊的大豆病株上获得一病毒分离物Ｓ１,温室人工摩擦接种７科１６种植物,Ｓ１能侵染其中的５科１４种植物．Ｓ１能由桃蚜、豆蚜以非持久性方式传毒,该分离物的钝化温度为５０～５５℃,稀释限点为１０－３～１０－４,体外保毒期为３～４ｄ（２５℃）．用昆诺藜作繁殖寄主可提到大量球状病毒粒子,ｄ为２５～３０ｎｍ．病毒外壳蛋白主要由两种亚基构成,Ｍｒ分别为４４．７×１０３和２１．９×１０３,病毒基因组由两条ＲＮＡ分子组成,大小分别为６．２ｋｂ与３．８ｋｂ,Ｎｏｒｔｈｅｒｎｂｌｏｔ结果显示３．８ｋｂＲＮＡ与ＢＢＷＶ２蚕豆分离物ＲＮＡ２ｃＤＮＡ有明显杂交反应．病毒粒子电泳后产生相似于豇豆花叶病毒科的快、慢两个电泳型．琼脂双扩散试验中,Ｓ１和ＢＢＷＶ２均能与蚕豆萎蔫病毒２（ＢＢＷＶ２）抗血清形成明显沉淀线,且沉淀线互相融合,Ｗｅｓｔｅｒｎ检测亦表明,此分离物的大小亚基均可与ＢＢＷＶ２抗血清反应．根据以上特性,Ｓ１分离物被鉴定为ＢＢＷＶ２．     

应用AFLP技术对斜茎黄芪根瘤菌遗传多样性的分析研究

采用ＡＦＬＰ指纹图谱分析技术对来自我国不同地区的９５株斜茎黄芪根瘤菌及２４株已知根瘤菌的参比菌一起进行遗传多样性研究．结果表明,在５０％相似性水平上,全部菌株被分为３１个ＡＦＬＰ群,显示出极大的遗传多样性．相关性较高的菌株的聚类结果与先前的表型性状数值分析结果相一致．具相同ＡＦＬＰ指纹图谱的菌株都具有相同的生长速度,且其中大部分菌株来自我国同一地区,同时具很高的表型相似性．此外,本研究表明,ＡＦＬＰ指纹技术具更高的分辩率,更能揭示种内的遗传多样性     

山西根瘤菌资源多样性与特异性研究

从山西不同生态条件下,采集豆科植物根瘤,经分离、纯化、回接原寄主,获得来自３１属７１种豆科植物寄主的纯根瘤菌株２１２株．对１５４株进行了ＢＴＢ反应和生长速度测定,在ＹＭＡ培养基上产酸快生型占９７．４％．选用了其中５０株,以快生型苜蓿根瘤菌（Ｒ．ｍｅｌｉｌｏｔｉ）和豌豆根瘤菌（Ｒ．ｌｅｇｕｍｉｎｏｓａｒｕｍ）各３株为ＣＫ,进行了其它生理生化鉴定．结果表明,５６株参试菌株均不产生３－酮基乳糖．山西分离的菌株能在蛋白胨肉汤上生长的１３株;能利用柠檬酸盐的７株;石蕊牛奶反应,产酸的１２株,其中酸凝的８株,产碱的３０株,其中胨化的１１株,石蕊还原的７株．唯一碳源和氮源利用比ＣＫ更广泛．对温度的适应范围宽．比ＣＫ有更强的耐盐、耐碱和对抗菌素的耐受能力     

现代分子生物学技术在动物肠道微生物多样性研究中的应用

现代分子生物技术的蓬勃发展解决了不可培养微生物研究的难题,使得肠道微生物的研究进入一个新的阶段.本文主要介绍了基于16SrRNA的分子分析技术,包括DGGE(变性梯度凝胶电泳),TGGE(温度梯度凝胶电泳),SSCP(单链构象多态性),RFLP(限制性片段长度多态性)等肠道微生物研究工作中常用的分子生物学技术方法、适用范围及可能的发展方向,为动物肠道微生物区系的进一步研究及开发应用提供帮助.表1参42     

中国林蛙Rana chensinensis遗传多样性初步研究

用寡聚核苷酸探针ＬＺＦ－１，对中国林蛙的基因指纹进行了研究，结果表明，中国林蛙３个居群扔Ｈｉｎｆ－１酶切片段的ＤＮＡ指纹图呈现在个体水平，群居水平和物种水平的高度多态性。     

DNA同源性分析最终确定新疆中华根瘤菌（Sinorhizobium xinjiangensis）为一独立种

针对S.xinjiangensis分类地位的争议,从新疆再次分离获得34株快生大豆根瘤菌,在16SrDNAPCR-RFLP分析和SDS全细胞蛋白电泳分群的基础上,进行了16SrDNA全序列相似性和DNA同源性分析.所测4个菌株和S.fredii模式菌株USDA205的16SrDNA全序列有很高的相似性.而DNA同源性分析说明新分离的菌株代表与原定的S.xinjiangensis为一个DNA同源群.其模式菌株CCBAU110与S.fredii的2株参比菌株USDA194、2048之间的DNA同源性分别为31.5%和28.7%.S.fredii的模式菌株USDA205与新分离的菌株代表及原定的S.xinjiangensis的模式菌株和2个参比菌株之间的DNA同源性为20.8%～39%,远低于70%.属于种水平上的差异.按照国际细菌分类委员会以DNA同源性≥70%且△Tm≤5℃作为定种的标准,S.xinjiangensis是Sinorhizobium属中不同于S.fredii的一个独立的种.表3参20