环境基因组技术在微生物多样性研究中的应用

环境中的微生物具有极大的生物多样性,但99%的微生物不能通过标准的实验技术加以培养,不依赖于培养的环境基因组技术由于适合分析生态系统中整个复杂的微生物基因组而迅速发展起来。文章针对环境基因组技术的原理、方法以及目前该技术在环境微生物多样性研究中的应用等作一综述。     

质谱法定量生态物种基因组DNA低甲基化

为了定量生态相关物种基因组中低丰度的5-甲基-2-脱氧胞苷(5-mdC),建立了一种采用高效液相色谱串联质谱(HPLC-MS/MS)的无标记方法.全基因组DNA甲基化计算公式5-mdC (mole)/(5-mdC (mole)+dC (mole)可以转化为1/(1+dC (mole)/5-mdC (mole)),然后通过HPLC-MS/MS得到DNA样品中5-mdC和dC的物质的量比(dC (mole)/5-mdC (mole))即可得到基因组DNA甲基化值.此外,还对HPLC条件进行了优化使正常核苷和修饰核苷基线分离,消除分析物的交叉干扰.本方法避免了使用昂贵的稳定同位素标记内标,在等度高效液相色谱条件下实现了正常和修饰核苷基线分离,5-mdC和dC的保留时间分别为5.50和3.06min.5-mdC和dC的定量限分别为14.2和19.1pg/mL.日内和日间偏差和准确性(相对误差)都≤ 10%.该方法测定的小牛胸腺DNA和大型蚤及秀丽线虫的全基因组DNA甲基化值分别为(6.44 ±0.25)%,(0.097 ±0.010)%和(0.025 ±0.002)%.采用HPLC-MS/MS技术建立并验证了一种快速、高精密度和灵敏度的DNA样品全基因组DNA甲基化测定方法,适用于评估环境污染物对生态学相关物种的潜在表观遗传风险.     

中国科学家克隆出世界首只转基因羊鹏鹏

中国首屈一指的基因组测序中心“华大基因”于4月18日宣布,该研究院与其他机构联合开展的科研项目取得重大进展,成功克隆出世界第一只转基因羊。这也是目前世界上首例采用“手工克隆”技术获得的转基因克隆绵羊。     

美科学家发现自私DNA在进化中起重要作用

自然界中的基因有千万种,哪类基因最为常见和最为丰富？南美国南佛罗里达州立大学、圣迭戈州立大学和芝加哥大学科学家组成的研究小组在对大量基因组进行成功解码后找到了答案,那就是有“自私DNA（脱氧核糖核酸）”之称的转座子。     

环球科技

<正>《自然—遗传》 2023年6月8日谷子，从主粮到杂粮再到“地球村的希望”10000多年前北京门头沟的先民吃的是什么主食？4000多年前的青海人用什么做面条？是什么作物让6000年前的中原人口第一次大幅度增加？考古证明，答案都是谷子，也就是人们俗称的小米。《自然—遗传》发表了中国农业科学院作物科学研究所研究员刁现民团队在全球首次完成的谷子高质量图泛基因组图谱。     

三河三湖水污染防治“十五”计划出台

据报道 ,按照国务院的要求 ,国家环保总局会同国家发展与改革委员会等部门和相关省、自治区、直辖市政府编制了“三河”、“三湖”水污染防治“十五”计划 ,并已经国务院批复实施。“计划”共确定了 15 90个项目 ,总投资 12 34亿元。主要包括城市污水处理、截污导流工程、农业面源污染治理、流域综合治理、引水工程等。“计划”的总目标是 ,到 2 0 0 5年 ,在淮河干流和主要支流不断流的情况下 ,淮河干流水质进一步好转 ,南水北调东线工程水质达标。海河干流及主要支流水质明显改善 ,饮用水源地控制断面水质达到饮用水标准。辽河全流域水体水…     

区域与城市生态保护研究基地首席专家简介

先后主持或参与完成了多项国家科技攻关计划项目、国际合作与地方服务项目．承担完成的主要项目有“生态环境质量评价与典型区应用研究”、“湖泊（滇池）城市饮用水源地污染防治技术研究”、“我国酸沉降及其生态环境影响”、“环北京周边沙漠化数据库建设”、“环境背景数据库建设”、“西部生态调查”、“中东部生态调查”、“长江流域洪水易损性评估”、     

美国100万幢屋顶太阳能计划

美国总统克林顿发表“100万幢屋顶太阳能动力”计划,至2010年在全美国100万幢大楼和住宅的屋顶设置太阳能发电系统(包括大阳热利用)。计划实施以能源部为主,由州政府、电力公司、地方团体、企业等协助,主要在联邦政府投资、补助和贷款的项目中实施。     

关于《国家环境保护"十五"计划》的说明

１《国家环境保护“十五”计划》的编制过程根据党中央、国务院和国家计委关于编制“十五”计划的总体部署，总局从１９９９年上半年开始，就着手组织了环保“十五”计划的编制工作。在总局党组和“十五”规划编制领导小组的领导下，经过各司（办）多次讨论修改，至２００１年初，基本完成了环保“十五”计划（初稿）编制工作。２００１年上半年，按照《国民经济和社会发展第十个五年计划纲要》（以下简称《“十五”计划纲要》）的要求，总局又对《国家环境保护“十五”计划》初稿进行了修改，并重点编制了项目规划。２００１年７月初，将环…     

中国环境科学研究院固体废物处理处置技术创新基地

中国环境科学研究院固体废物处理处置技术创新基地(即固体废物污染控制技术研究所,以下简称固体所)在固体废物的污染控制和资源再生利用等科研领域开展了多角度的研究,在致力于全国性、综合性的固体废物环境管理问题研究的同时,积极从事固体废物处理、处置实用技术的研究与开发,在固体废物处理、处置及管理方面的研究处于国内领先地位。10余年来,固体所共完成各类研究项目、立项课题100多项。主要有国家“八五”科技攻关计划项目“危险废物安全填埋技术研究”、“危险废物区域焚烧规划研究”;国家“十五”科技攻关计划项目“危险废物鉴别与…     

标准不能降 力度不能减 目标任务必须完成——孙瑞彬副省长在全省“双三十”节能减排2009年第二次调度会上的讲话（摘要）

今年是我省实施“双三十”节能减排工程的第二年,无论从今年工作进度,还是从三年整体进度看,目前时间都已过半。今年上半年各项工作进展顺利、效果明显,基本实现了时间、任务双过半。节能方面,“双三十”重点县（市、区）完成节能项目146项,超上半年计划22项,年可节能83万吨标准煤;重点企业完成节能项目47项,超上半年计划13项,年可节能32．3万吨标准煤。     

中原油田采油三厂560口油井全部进入冬季生产

中原油田采油三厂本着“不冻坏一台设备,不冻堵一寸管线,不使一口油井冬眠”的“三不”工作目标,早计划、早安排、早部署、早实施,11月底冬防保温工作全部完成。目前,全厂560口油井全部穿上“防寒服”,进入冬季安全生产。     

镉胁迫对菜豆幼苗基因组DNA多态性的影响

采用随机扩增多态性DNA (RAPD)等技术,检测不同浓度镉(Cd)胁迫对菜豆幼苗叶片DNA损伤及相关生理特性的影响.结果表明,随着Cd处理浓度(0,20,40,80mg/L)的增加,菜豆幼苗中的Cd含量及叶片中丙二醛(MDA)含量升高;叶片中可溶性蛋白、脯氨酸、还原型谷胱甘肽在低浓度(20mg/L)Cd处理下含量增加,中、高浓度(40,80mg/L)Cd处理下减少.选取8条寡核苷酸引物(10bp),利用RAPD随机扩增技术,对菜豆幼苗叶片细胞基因组DNA进行扩增,8条引物均产生特异性谱带.正常叶片基因组DNA的RAPD图谱得到46条谱带.与正常组相比,Cd处理下利用不同引物扩增得到的RAPD图谱发生改变,呈现不同程度的谱带强度增强或减弱、谱带缺失或新增,与对照的RAPD图谱存在明显差异.Cd胁迫下基因组模板稳定性下降,并随Cd处理浓度的增加,稳定性下降幅度增大.利用RAPD技术获得的DNA多态性变化,可指示镉毒害生物遗传效应,并为镉污染地区蔬菜品种的选育及镉毒性的评价提供依据.     

海洋甲藻的单细胞PCR技术初步研究

甲藻是引发赤潮的重要种类。但是由于某些种类个体微小、形态近似,很难通过光学形态特征准确鉴定。单细胞PCR是一种快速、有效的分子鉴定方法。分别用戊二醛、鲁哥氏液和福尔马林固定塔玛亚历山大藻(Alexandrium tarmarense)。塔玛亚历山大藻单细胞全基因组扩增后进行单细胞PCR扩增,结果显示:1个月内,2%戊二醛和鲁格氏液固定甲藻均能用于单细胞PCR分析,而福尔马林固定甲藻则不适宜单细胞PCR分析。同时,2%戊二醛固定大连凌水湾海域甲藻样品,结合光学形态特征分析和单细胞PCR,成功鉴定了环境样品中的锥形多甲藻。     

深化统计改革,发挥整体功能——张坤民副局长在全国环境统计工作会议上的报告

同志们: 这次全国环境统计工作会议,是在完成了“七五”计划,开始执行“八五”计划的时候召开的,它负有承前启后的历史使命,是一次十分重要的会议。现在,我代表国家环境保护局对“七五”期间的环境统计工作进行初步总结,并提出“八五”期间的目标和主要任务。一、“七五”时期环境统计工作的回顾环境统计的基本任务是对环境状况和环境保护工作情况进行统计调查、统计分析,提供统计资料,实行统计监督。“七五”期间,全国广大环境统计人员认真学习、贯彻《中华人     

邯郸市：开展“雷霆行动”淘汰落后产能

按照全省“三项集中行动”的安排部署,为确保完成全市08年节能减排目标,邯郸市委、市政府决定在全市范围内组织开展以淘汰落后产能为主要内容的为期一个月的节能减排“雷霆行动”。按照计划,落后产能集中爆破拆除活动从10月13日起,10月23日前完成,全市将集中10天时间,对60家钢铁、水泥、     

IEM-UF同步分离反硝化系统脱氮特性及种群结构分析

针对传统脱氮工艺处理低C/N污水存在的问题,本研究提出IEM-UF同步分离反硝化系统.考察了三阶段各反应器对系统COD去除与脱氮性能影响,同时应用宏全基因组技术分析了各反应器功能微生物种群结构特征.结果表明,系统在电流强度0. 2A时分离器氨氮富集率平均达到116. 1%,最高可达170%;系统进水C/N为2. 80稳定运行时,系统COD及TN平均去除率分别可以达到90%和50%以上. TN去除率最高达到65. 4%.宏全基因组测序表明,在硝化反应器中硝化螺旋菌属(Nitrospira)和亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)所占比例分别为12. 23%和2. 31%;在反硝化反应器中脱氯单胞菌属(Dechloromonas)、陶厄氏菌属(Thauera)和Azospira所占比例分别为4. 57%、1. 76%和1. 03%,远大于其他菌属所占比例,保证了系统中COD、NH_4~+-N、NO_x~--N较高的去除率;同时铁自养反硝化菌的存在提高了系统的反硝化效率.     

广东环保将实施“一,二,三,四”工程

又是春天,又到希望播种时。新的一年,广东环保干些什么?1月14日结束的广东省环保工作会议上,副省长汤炳权与省、市环保局长一起敲定了盘子,就是要抓好“一、二、三、四”工程。一是指狠抓一个重点,即“一控双达标”;二是指完成两项任务,即机构改革和制定“十五”计划;三是指实施三大举措,即《广东省碧水工程计划》、《广     

冀州市综合施策促减排

一是严格落实总量控制制度,制定污染物总量控制计划,严格落实环境影响评价和“三同时”制度,坚持“以新带老”,确保完成主要污染物减排任务;二是要加大重点排污企业治理力度,大力推动产业结构优化升级,坚决制止高耗能、高污染项目建设。     

淮河,太湖流域省界水质监测断面水质目标

1996年6月和1998年1月，国务院分别批复了《淮河流域水污染防治规划及“九五”计划》和《太湖水污染防治“九五”计划及2010年规划》（以下简称《淮河规划》和《太湖规划》，作为淮河、大湖水资源保护和水污染防治工作的重要依据，并明确指出淮河、太湖的经济建设活动必须符合《淮河规划》和《太湖规划》的要求。《淮河规划》明确了1997年实现全流域工业污染源达标排放，2000年实现淮河水全变清的目标。提出了淮河流域水污染物排放总量控制目标．即1997年，全流域化学需氧量最大允许排放总量为8902万吨，2000年，全流域化学需氧量最大允许排…