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环境微生物群落分析的T-RFLP技术及其优化措施 总被引:21,自引:1,他引:21
末端限制性酶切片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism, T-RFLP)是近年来发展起来的、不依赖于培养的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落结构分析方面的特点,包括分辨率高、易于实现自动化及互联网海量数据共享等优势,自1997年最先被报道以来得到了广泛的应用,成为环境微生物群落分析的最强有力的工具之一.本文详细介绍了T-RFLP技术的原理,并从环境样品群落DNA的提取、引物设计和PCR扩增、限制性酶切、电泳分离检测和T-RFLP图谱解析等5个方面讨论了用该技术解析环境微生物群落的方法和技巧,简述了近8 a来国外T-RFLP技术在群落分析中的研究进展.类似于其他的分子微生物生态学技术, T-RFLP也有自身的缺陷,因此重点分析了该技术的局限性及相应的解决办法.图2表1参62 相似文献
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Wan Nur Dinie Hidayah Wan Azman Mohd Amir Asyraf Mohd Hamzah Maizatulakmal Yahayu Zainul Akmar Zakaria 《环境质量管理》2023,33(1):13-22
The rise in the number of fungi that resisted antifungal action is of serious concern nowadays. In this study, the potential of acid condensate (AC) produced from microwave-assisted pyrolysis of palm kernel shell (PKS) was investigated for its antifungal properties through molecular docking evaluation. The phenolic-rich AC was determined for its chemical compositions using the GC–MS analysis where compounds with the highest phenolics content were further evaluated (using the Autodock Tools 1.5.7) for its potential enzymes/protein binding properties. From the GC–MS analysis, catechol, guaiacol and syringol were present at highest percentages. This directly correlates with results obtained from the molecular docking works where all these ligands managed to bind (indicated by H-bond, π-stacking, hydrophobic interaction) with some of the amino acid at the active sites which indicate its potential to inhibit substrate binding of this enzyme. As a conclusion, this study demonstrated the potential use of AC from agricultural biomass such as PKS as a natural-based antifungal agent that can reduce environmental and health impacts. 相似文献
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为揭示不同植被恢复模式对土壤有机碳分子结构及其稳定性的影响机理,分别在浙江凤阳山国家级自然保护区的石梁岙和凤阳湖设置样地,采用13C核磁共振技术分析常绿阔叶林与杉木林、柳杉林与针阔混交林全土和不同粒级(0~0.5、>0.5~2.0、>2.0~5.0、>5.0 mm)土壤团聚体中有机碳的质量分数及其分子结构特征. 结果表明:①常绿阔叶林0~20 cm层全土w(有机碳)(12.84 g/kg)显著高于杉木林(9.98 g/kg),柳杉林(13.93 g/kg)显著高于针阔混交林(11.54 g/kg) (P<0.05). 不同植被恢复模式下,土壤团聚体w(有机碳)总体上均随着粒径的增大呈降低趋势. ②与杉木林相比,常绿阔叶林全土有机碳中w(烷氧碳)较高,w(烷基碳)、w(芳香碳)、w(烷基碳)/w(烷氧碳)、w(疏水碳)/w(亲水碳)则较低,显示常绿阔叶林全土有机碳稳定性较差;与针阔混交林相比,柳杉林全土有机碳中w(烷基碳)、w(烷基碳)/w(烷氧碳)、w(疏水碳)/w(亲水碳)较高,w(烷氧碳)则较低,显示柳杉林全土有机碳稳定性较好. 与0~20 cm层相比,不同植被恢复模式下>20~40 cm层全土w(烷氧碳)均明显降低,w(烷基碳)、w(烷基碳)/w(烷氧碳)、w(疏水碳)/w(亲水碳)均明显升高,有机碳稳定性变好. ③随着粒径的增大,不同植被恢复模式下土壤团聚体的w(烷基碳)、w(烷基碳)/w(烷氧碳)、w(疏水碳)/w(亲水碳)均呈降低趋势,w(烷氧碳)均呈升高趋势,说明团聚体结合的有机碳稳定性逐渐变差. 研究显示,不同植被恢复模式下的不同树种组成是影响土壤有机碳质量分数及其分子结构、稳定性差异的主要因素. 相似文献
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从2009年7月~2010年3月每月采集西太湖表层水样,分析叶绿素含量﹑蓝藻细胞裂解速率﹑磷酸盐浓度的变化,并通过切向流超滤系统分离得到的高分子量(1kDa~0.5μm)溶解性有机物的碳氮比值和高分子量溶解性有机碳浓度的变化.结果表明,西太湖蓝藻细胞裂解速率在11月达到最大值(0.43d-1),而磷酸盐和高分子量溶解性有机碳浓度分别在12月与9月达到最大值.细胞裂解速率与磷酸盐﹑高分子量溶解性有机碳浓度之间没有相关性,说明水华过后影响磷酸盐浓度﹑高分子量溶解性有机碳的因素很多,蓝藻细胞裂解只是其中重要因素之一.藻类水华的出现可能导致水体中其它磷形态(如有机磷)与磷酸盐之间的迁移转化,而大型浅水湖泊扰动导致的沉积物再悬浮和水华过后频繁的细菌活动都可能是影响高分子量溶解性有机碳的因素.秋季水华过后蓝藻细胞裂解释放的有机碳进入微食物网循环,引起细菌活动频繁,而溶解性有机物中含碳化合物比含氮化合物容易降解,所以碳氮比值逐渐减少.此外细菌通过硝酸盐合成溶解性有机氮也可能是碳氮比值减少的一个重要原因. 相似文献
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Octanol‐water partition coefficients (Kow) and soil organic carbon sorption coefficients (Koc) were determined for 14 fluorinated benzene derivatives. Quantitative structure‐property relationships were developed using molecular connectivity indices and quantum chemical parameters to analyze the most significant factors influencing these physico‐chemical properties of the compounds. The substitution by F in benzene derivatives has greater influence on Koc than on Kow. 相似文献
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发酵制药废水二级出水中溶解性有机物特性分析 总被引:1,自引:1,他引:0
溶解性有机物(DOM)是发酵制药废水二级生化尾水深度处理工艺的主要去除对象,深入解析废水中DOM的特性是将其有效去除的前提和关键.本研究采集氨基酸类、头孢类、抗生素类、维生素类、阿维菌素类5种发酵制药废水二级出水,通过XAD-8树脂亲疏水性分离、凝胶色谱分子量分级、傅里叶变换红外光谱和三维荧光表征对二级出水中的DOM进行特性分析.结果表明,5种发酵制药废水二级出水的盐度和色度高,废水中有机物浓度高、波动大(48.60~245.40 mg·L-1).DOM大多数以疏水性组分为主,分子量分布广泛(210~10000 Da).二级出水DOM均含有大量的不饱和双键、苯环结构,同时含有—OH、—NH2和C=O等发色团和助色基团,造成废水色度较高.通过对发酵制药废水二级出水进行EEM-PARAFAC分析确定了4种荧光组分特征峰,包括3种腐殖质类(C1、C3、C4)和1种类蛋白类组分(C2).发酵制药废水二级出水中DOM主要是以类腐殖质有机物为主(C1、C3).全方面识别和解析发酵制药废水DOM的组成,可为废水深度处理工艺的优化提供指导. 相似文献
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