Importance of timely metadata curation to the global surveillance of genetic diversity

Genetic diversity within species represents a fundamental yet underappreciated level of biodiversity. Because genetic diversity can indicate species resilience to changing climate, its measurement is relevant to many national and global conservation policy targets. Many studies produce large amounts of genome-scale genetic diversity data for wild populations, but most (87%) do not include the associated spatial and temporal metadata necessary for them to be reused in monitoring programs or for acknowledging the sovereignty of nations or Indigenous peoples. We undertook a distributed datathon to quantify the availability of these missing metadata and to test the hypothesis that their availability decays with time. We also worked to remediate missing metadata by extracting them from associated published papers, online repositories, and direct communication with authors. Starting with 848 candidate genomic data sets (reduced representation and whole genome) from the International Nucleotide Sequence Database Collaboration, we determined that 561 contained mostly samples from wild populations. We successfully restored spatiotemporal metadata for 78% of these 561 data sets (n = 440 data sets with data on 45,105 individuals from 762 species in 17 phyla). Examining papers and online repositories was much more fruitful than contacting 351 authors, who replied to our email requests 45% of the time. Overall, 23% of our email queries to authors unearthed useful metadata. The probability of retrieving spatiotemporal metadata declined significantly as age of the data set increased. There was a 13.5% yearly decrease in metadata associated with published papers or online repositories and up to a 22% yearly decrease in metadata that were only available from authors. This rapid decay in metadata availability, mirrored in studies of other types of biological data, should motivate swift updates to data-sharing policies and researcher practices to ensure that the valuable context provided by metadata is not lost to conservation science forever.     

玛纳斯河水质参数时空变化规律与趋势分析

干旱区水环境质量的好坏直接决定着绿洲经济建设的水平.通过对玛纳斯河15年来的水质监测资料的分析、研究,从中寻找出该流域的地表及地下水质变化规律与发展趋势.研究结果表明：玛河径流形成区及山前倾斜平原区水质一直保持在一级未受污染级别;山前倾斜平原区地下水中挥发酚以及氮素含量逐年上升,但总体水质仍然保持在一级未受污染级别的范围.     

沿固体木板面火蔓延状况的影像测量方法研究

本文就火在固体木板面蔓延的影像测量方法进行了研究，提出了利用彩色序列影像进行固体木板表面火蔓延状况测量的新方法，通过对垂直木板面和倾斜木板面火蔓延的实际测量试验，验证了该方法的有效性。     

16S rRNA基因技术在环境科学领域中的应用

随着分子生物学的发展，16S rRNA基因技术被逐渐应用到环境科学领域中。目前在环境保护和治理中，该技术主要被用于鉴定污染物的生物降解菌和分析环境样品中的微生物群落多样性，由于它不必将微生物培养分离出来，也就避免了在培养过程中可能出现的微生物去失的情况。本文对16S rRNA基因技术及其在环境科学领域中的应用现状和发展作了一简要介绍，并对16S rRNA基因技术存在的不足进行了讨论。     

水解酸化-UASB-SBR组合法处理印染废水

根据印染废水的特性，提出了水解酸化－UASB－SBR组合法处理的处理方法。该不的实际应用表明，废水CDO用2500－4500mg/L降至80－150mg/L,BOD5，可由600－1000mg/L降至30-40mg/L，色度可由100－600倍降至50－60倍，该法具有以废治废，投资少，运用费用低，操作简单的特点。     

非线性时序法在城市大气污染预测中的应用

建立城市大气污染预测模型是治理城市大气污染的重要工作。在简述时间序列方法基本原理的基础上，分析了系数为变量的自回归滑动平均（ARMA）模型、截断ARMA模型，和残差为自回归综合滑动平均（ARIMA）的半参数方法等城市大气污染预测模型。以法国某城市为例，分别采用AR模型和系数为变量的AR模型对大气污染进行了预测。通过比较预测结果可知，基于非线性时间序列方法的城市大气污染预测模型可以提高预测精度，降低预测误差。     

中国安全经济贡献率的计量分析

安全经济贡献率的准确计算对于指导国家安全投入力度和宏观安全决策起着重要作用。为了准确计算中国安全生产对经济的贡献率,以弥补以往经验取值方法的局限,笔者通过建立计量经济学模型,获得了精确的安全产出与安全投入的函数关系,并得出我国安全生产规模报酬递增的结论。在此基础上又建立时间序列模型,预测出我国2005年的安全经济贡献率为3.01%,安全投入产出比为1.00∶1.81。从预测结果来看,计量模型收到了满意的结果,对国家宏观安全决策具有一定的指导意义。     

一株萘降解菌的分离鉴定及其降解特性研究

从某焦化厂活性污泥曝气池中筛选出1株能够以萘为唯一碳源生长的优势降解菌株ZJ2H.通过形态学观察、生理生化试验、16S rDNA序列及系统发育学分析,确定菌株ZJ2H为解甘露醇罗尔斯顿菌(Ralstonia mannitolilytica).考察了初始底物质量浓度、投菌量、pH值、温度、盐质量浓度和转速等因素对该菌降解...     

单一和复合溶液中Cu~(2+)对三种土壤SeO_3~(2-)吸附的影响

采用批量吸附实验,研究了塿土、黑土和红壤对单一Se O2-3及其与Cu2+共存条件下的吸附特征,并分析了Cu2+添加顺序对3种土壤Se O2-3吸附的影响,旨在为揭示土壤中铜硒复合污染中金属的迁移转化提供依据.结果表明,塿土、黑土和红壤对单一及Cu2+-Se O2-3复合溶液中Se O2-3的吸附是一个先快后慢的过程,24 h基本达到吸附平衡,且其对单一及复合溶液中Se O2-3的吸附均符合二级动力学方程(R20.994),说明化学吸附是主要限速步骤.3种土壤对单一Se O2-3的吸附符合Langmuir方程(R20.937),而先铜后硒、铜硒共同吸附处理Se O2-3的吸附却符合Freundlich方程(R20.928),表明加入Cu2+后,土壤对Se O2-3的吸附由单分子层化学吸附转变为多分子层表面吸附.当Se O2-3浓度为50μg·L-1时,Cu2+对塿土Se O2-3吸附无显著影响,而黑土和红壤的Se O2-3吸附却随Cu2+浓度的升高而降低;且Cu2+的添加顺序对3种土壤Se O2-3吸附无显著影响.当Se O2-3浓度为200μg·L-1时,塿土对Se O2-3的吸附随Cu2+浓度的升高而下降,黑土和红壤Se O2-3吸附量则呈先降低后略微升高的趋势,且当Cu2+浓度为160 mg·L-1时,其添加顺序对3种土壤Se O2-3吸附达到显著影响(p0.05).总之,在单一及复合溶液中土壤对Se O2-3的吸附随土壤类型而异,Cu2+的添加抑制了3种土壤对Se O2-3的吸附,且Cu2+添加顺序对Se O2-3吸附的影响与铜、硒离子浓度有关.     

斜带石斑鱼alpha型与rho型GST基因cDNA全序列的克隆与分析

为从分子水平上研究II相去毒酶谷胱甘肽S-转移酶(Glutathione S-transferase,GST)在斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)等海水鱼类机体内代谢去毒过程中的作用及机制,采用RT-PCR及RACE法,分离、克隆得到斜带石斑鱼肝脏alpha-GST(GSTA)、rho-GST(GSTR)基因cDNA全序列.序列分析结果表明,斜带石斑鱼肝脏GSTA基因cDNA全长1008bp,编码223个氨基酸;GSTR基因cDNA全长1002bp,编码225个氨基酸.构建系统进化树发现,斜带石斑鱼与鲤鱼、斑马鱼GSTA氨基酸同源性较高,而GSTR为鱼类所特有并共同占据进化树上独立的分枝,与大鼠、小鼠、人等哺乳动物GST现有所有类型同源性均较低.