| Genome-wide identification and hormone expression patterns of the MaPIF family of banana genes北大核心CSCD |
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| 作者姓名： | 吴昊张城瑜倪珊珊罗彬彬王梦鸽魏雯敏陈裕坤赖钟雄 |
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| 作者单位： | 1.福建农林大学园艺植物生物工程研究所350002; |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2019YFD1000900)；国家现代农业产业技术体系(香蕉)专项资金项目(GARS-31-15)；福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2013119,CXZX2017351)资助。 |
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| 摘 要： | 植物光敏色素作用因子(phytochrome interacting factor,PIF)是广泛分布于植物体内的一种转录因子,在植物的生长发育方面有着重要的作用.基于香蕉基因组数据,对香蕉MaPIF基因家族进行基因组鉴定,采用生物信息学分析方法对其进行命名,分析理化性质、蛋白质结构、基因结构、启动子顺势作用元件以及构建系统进化树;分析PIF家族在不同激素处理下的表达情况.结果显示,香蕉MaPIF家族有7个成员,均含有高度保守的bHLH结构域;编码区长度在1 116-2001bp之间,至少包含5个内含子,且大部分位于细胞外;进化树结果可以发现与拟南芥、水稻以及玉米PIF的亲缘关系较近;顺式作用元件预测结果显示,MaPIF上存在多种与激素和光相关的响应元件.qRT-PCR结果显示,MaPIF3-1、MaPIF4、MaPIF4-1在生长素(IAA)、赤霉素(GA)、生长素抑制剂(NPA)处理中均有显著表达,除此之外,所有成员在脱落酸(ABA)处理下均有明显表达.本研究表明MaPIF在香蕉生长发育中激素调控有重要作用.(图7表3参45)
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| 关 键 词： | 香蕉 PIF 基因家族分析 激素 基因表达 |
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