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甲型流感病毒H5N1的siRNA设计
引用本文:
郭骁才,郭红霞.甲型流感病毒H5N1的siRNA设计[J].应用与环境生物学报,2004,10(1):133-138.
作者姓名:
郭骁才
郭红霞
作者单位:
中国科学院成都生物研究所,成都,610041
摘 要:
选用了甲型流感病毒10个毒株(全序列)和一个2004年越南毒株(部分序列),采用自己编写的计算机程序sRNAFinder,对每个毒株的6个RNA片段的6个编码序列进行了siRNA设计.结合系统发育重建方法,利用sR-NAFinder的共有序列分析功能,对得到的6101个siRNA分子进行了计算机筛选.结果表明,设计的siRNA的分子,针对np和pb1应该是最有效的,而针对ha和na的siRNA分子设计,需要疾病流行期毒株的最新测序数据;从ns1的数据不能获得很保守的、可作为预防治疗药物的siRNA分子.图1表4参16
关 键 词:
甲型流感病毒
siRNA
系统发育重建
计算机筛选
禽流感
修稿时间:
2004年2月19日
siRNA DESIGN TO THE H5N1 SUBTYPE OF INFLUENZA A VIRUS
Abstract:
Keywords:
influenza A virus
H5N1 subtype
siRNA
sRNAFinder program
phylogenetic reconstruction
computer
screening
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