甲型流感病毒H5N1的siRNA设计 |
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引用本文: | 郭骁才,郭红霞. 甲型流感病毒H5N1的siRNA设计[J]. 应用与环境生物学报, 2004, 10(1): 133-138 |
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作者姓名: | 郭骁才 郭红霞 |
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作者单位: | 中国科学院成都生物研究所,成都,610041 |
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摘 要: | 选用了甲型流感病毒10个毒株(全序列)和一个2004年越南毒株(部分序列),采用自己编写的计算机程序sRNAFinder,对每个毒株的6个RNA片段的6个编码序列进行了siRNA设计.结合系统发育重建方法,利用sR-NAFinder的共有序列分析功能,对得到的6101个siRNA分子进行了计算机筛选.结果表明,设计的siRNA的分子,针对np和pb1应该是最有效的,而针对ha和na的siRNA分子设计,需要疾病流行期毒株的最新测序数据;从ns1的数据不能获得很保守的、可作为预防治疗药物的siRNA分子.图1表4参16
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关 键 词: | 甲型流感病毒 siRNA 系统发育重建 计算机筛选 禽流感 |
修稿时间: | 2004-02-19 |
siRNA DESIGN TO THE H5N1 SUBTYPE OF INFLUENZA A VIRUS |
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Abstract: | |
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Keywords: | influenza A virus H5N1 subtype siRNA sRNAFinder program phylogenetic reconstruction computer screening |
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