| 基于eDNA宏基因组的草海湖泊硅藻群落及多样性分析 |
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| 引用本文： | 郭金,蒋娟,龙云川,代亮亮,苏荣翔,陈颜明.基于eDNA宏基因组的草海湖泊硅藻群落及多样性分析[J].环境科学研究,2024(5):1027-1036. |
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| 作者姓名： | 郭金 蒋娟 龙云川 代亮亮 苏荣翔 陈颜明 |
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| 作者单位： | 1. 贵州科学院贵州省生物研究所;2. 贵州科学院草海生态站;3. 贵州草海国家级自然保护区管理委员会 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No.32360036)； |
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| 摘 要： | 环境DNA(eDNA)技术作为新兴生物多样性监测方法，具有非侵入性、高效性及灵敏性的特点.为探究基于宏基因组测序的eDNA技术对喀斯特湖泊硅藻监测的适用性，以贵州草海为例，采集草海湖滨带的水样及表层沉积物样品，运用宏基因组学与eDNA相结合的方法，分析浮游及沉积硅藻的群落组成、生物多样性及KEGG代谢功能.结果表明：(1)草海硅藻群落共注释到4纲23目36科54属78种，在科分类阶元上以舟形藻科和海链藻科为优势类群.硅藻群落的Chao1指数平均值为42.88±15.35,Shannon-Wiener指数平均值为2.09±0.29.(2)硅藻群落KEGG通路功能最具代表性的是全局和概述图谱(global and overview maps)，其次是能量代谢、翻译；优势KO基因主要为atpF基因、secA基因、rplT基因、rpoA基因、argH基因.(3)主坐标分析(PCoA)和相似性分析(ANOSIM)表明硅藻群落存在显著的环境介质差异；LEfSe分析揭示浮游硅藻群落的差异标志物主要为海链藻属(Thalassiosira)、小环藻属(Cyclotella)，沉积硅藻主要是管状藻属(Fi...
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| 关 键 词： | 硅藻群落 高原湿地 宏基因组 环境DNA |
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