| 基于EST-SSR标记的沙棘品种鉴定及指纹图谱构建 |
| |
| 引用本文： | 赵雨欣,张哲文,考惠霞,孙永江,辛智鸣,赵喆,董树斌,程瑾.基于EST-SSR标记的沙棘品种鉴定及指纹图谱构建[J].生态与农村环境学报,2024(3):374-385. |
| |
| 作者姓名： | 赵雨欣 张哲文 考惠霞 孙永江 辛智鸣 赵喆 董树斌 程瑾 |
| |
| 作者单位： | 1. 北京林业大学生物科学与技术学院/林木育种与生态修复国家工程中心/花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室;2. 北京林业大学林学院/森林培育与保护教育部重点实验室;3. 中国林业科学研究院沙漠林业实验中心 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划政府间国际科技创新合作专项(2019YFE0116500)；;高等学校学科创新引智计划111项目(B13007)； |
| |
| 摘 要： | 以沙棘(Hippophae rhamnoides)优良品种“实优1号”为材料，对其叶片进行转录组测序，利用微卫星识别软件(microsatellite identification tool, MISA)和Primer 3(version 2.3.4)对获得的序列进行简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)位点挖掘和引物设计，以收集的42份沙棘品种为研究材料，开展聚合酶链式反应(PCR)和毛细管电泳检测，旨在开发一套多态性高、稳定性好和通用性强的表达序列标签微卫星(express sequence tags from simple sequence repeat, EST-SSR)引物，构建沙棘指纹图谱，从而实现沙棘品种的快速准确鉴定，并对沙棘品种间亲缘关系进行分析。“实优1号”转录组测序共获得6 196个SSR位点，其中，重复基元类型为182种，SSR基序长度主要分布在10～21 bp区间，占全部SSR的81.58%,主要SSR重复类型为单核苷酸重复(48.72%)、二核苷酸重复(22.68%)和三核苷酸重复(18.85%)。利用筛选出的28对引物在42...
|
| 关 键 词： | 沙棘 表达序列标签微卫星 指纹图谱 遗传多样性 |
|
|
