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龙眼miR403及其候选靶标对外源激素的响应模式以及在龙眼体胚中的表达模式
引用本文:苏立遥,黄倏祺,蒋梦琦,厉雪,徐小萍,陈旭,赖钟雄,林玉玲.龙眼miR403及其候选靶标对外源激素的响应模式以及在龙眼体胚中的表达模式[J].应用与环境生物学报,2019(4):977-984.
作者姓名:苏立遥  黄倏祺  蒋梦琦  厉雪  徐小萍  陈旭  赖钟雄  林玉玲
作者单位:福建农林大学园艺植物生物工程研究所
基金项目:国家自然科学基金项目(31672127,31572088);福建省高原学科建设经费(102/71201801101);福建农林大学园艺学院优秀硕士学位论文基金(2018S02)资助
摘    要:MicroRNA403(miR403)为双子叶植物特有的miRNA家族,其在双子叶植物抗病、逆境胁迫和生长发育中具有重要作用.为了解miR403及其候选靶标对外源激素的响应模式以及在龙眼体胚发生过程中的表达模式,利用psRNAtarget对miR403潜在靶标进行预测,采用改良RLM-RACE技术验证其裂解位点,通过qPCR技术检测miR403及其候选靶标对外源激素的应答及在龙眼体胚中的表达模式.结果显示,共获得41个龙眼miR403的潜在靶标,包含4个PPR(Pentatricopeptide repeat protein)和3个PCNT115(Auxin-induced protein PCNT115),却未发现AGO2(Argonaute2).4个PPR中Dlo014588.1和Dlo014589.1序列一致,而3个PCNT115基因序列在所预测的miR403结合位点上下游序列基本一致.裂解位点显示,miR403不具备裂解AGO2 mRNA的能力,但介导PPR(Dlo014588.1)和PCNT115 mRNA的裂解,裂解位点位于miR403 5′端的第2和第3个碱基之间. qPCR显示,miR403响应脱落酸(ABA)信号并显著上调,PPR和PCNT115对不同浓度的ABA呈现不同的表达模式,PPR和PCNT115在5μg/L ABA时显著上调,随后,PPR先显著下调(50μg/L ABA),而后显著上调(5 000μg/L ABA),而PCNT115呈显著下调趋势;miR403不响应赤霉素(GA3)信号,而PPR和PCNT115随着GA3浓度升高而上调;miR403可以响应不同浓度的水杨酸(SA)和2,4-D信号显著下调,而其靶基因显著上调.不同胚性培养物中qPCR显示,miR403仅在龙眼胚性愈伤组织(EC)高度表达且在龙眼体胚发生过程中显著下调,PPR在EC和子叶胚(CE)高度表达,PCNT115在CE和成熟胚(ME)高水平表达,三者之间并未呈现明显的负调控趋势.本研究表明在龙眼体胚中miR403并不靶向调控AGO2,而是调控PPR和PCNT115;另外,miR403可能响应ABA、SA和2,4-D调控PPR和PCNT15参与到龙眼体胚发生过程中.

关 键 词:龙眼  miR403  靶基因  PPR  PCNT115  AGO2  激素响应  体胚发生

The response patterns of miR403 and its candidate targets to exogenous hormones and their expression profiles in the longan somatic embryo
SU Liyao,HUANG Shuqi,JIANG Mengqi,LI Xue,XU Xiaoping,CHEN Xu,LAI Zhongxiong,LIN Yuling.The response patterns of miR403 and its candidate targets to exogenous hormones and their expression profiles in the longan somatic embryo[J].Chinese Journal of Applied and Environmental Biology,2019(4):977-984.
Authors:SU Liyao  HUANG Shuqi  JIANG Mengqi  LI Xue  XU Xiaoping  CHEN Xu  LAI Zhongxiong  LIN Yuling
Institution:(Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China)
Abstract:SU Liyao;HUANG Shuqi;JIANG Mengqi;LI Xue;XU Xiaoping;CHEN Xu;LAI Zhongxiong;LIN Yuling(Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China)
Keywords:Dimocarpus longan  microRNA403  target gene  pentatricopeptide repeat protein  auxin-induced protein PCNT115  Argonaute 2  hormone response  somatic embryogenesis
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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