| 双酚A诱导下双齿围沙蚕实时荧光定量P CR内参基因的筛选 |
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| 引用本文： | 薛圣伦,黄艺,孙嘉,杨大佐,周一兵,赵欢.双酚A诱导下双齿围沙蚕实时荧光定量P CR内参基因的筛选[J].生态毒理学报,2019,14(1):144-152. |
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| 作者姓名： | 薛圣伦 黄艺 孙嘉 杨大佐 周一兵 赵欢 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学,辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023;大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,大连116023;大连海洋大学,辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023;大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,大连116023;大连海洋大学,辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023;大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,大连116023;大连海洋大学,辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023;大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,大连116023;大连海洋大学,辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023;大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,大连116023;大连海洋大学,辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023;大连海洋大学,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,大连116023 |
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| 基金项目： | 辽宁省大型仪器设备共享服务平台能力建设基金；农业农村部北方海水增养殖重点实验室开放课题(2018-KF-15) |
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| 摘 要： | 为了筛选出在双酚A诱导下双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)体壁组织中最适内参基因,以不同浓度双酚A诱导下双齿围沙蚕互补脱氧核糖核酸(cDNA)为模板进行实时荧光定量PCR,利用Ge Norm、Norm Finder和Bestkeeper三个软件对肌动蛋白(beta-actin, Actin)、核糖体蛋白5(ribosomal protein L5, RPL5)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, GAPDH)、微管蛋白(β-tubulin, Tub)、琥珀酸脱氢酶(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A, SDHA)和组蛋白(Histone Cluster 1 H_2A Family Member A, HH_2A)这6个备选内参基因的表达量进行分析,筛选出稳定表达的内参基因。结果表明6个内参基因的基因表达量由大到小为ActinGAPDHSDHAHH_2ATubRPL5,Bestkeeper软件分析得到6种内参基因稳定性排名为ActinRPL5SDHATubHH_2AGAPDH,Ge Norm软件分析得出6种内参基因的稳定性排名为SDHARPL5ActinTubHH_2AGAPDH,Normfinder分析的结果为ActinSDHARPL5TubHH_2AGAPDH。综合以上结果确定双酚A诱导下双齿围沙蚕最优内参基因为Actin,不推荐GAPDH作为内参基因使用。推荐同时选取多对内参基因进行实验,可以进一步减少误差。
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| 关 键 词： | 双酚A 双齿围沙蚕 内参基因 Actin |
| 收稿时间： | 2018/9/9 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/1/28 0:00:00 |
Reference Gene Selection for Quantitative Real-Time PCR in Perinereis aibuhitensis under BPA Exposure |
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| Xue Shenglun,Huang Yi,Sun Ji,Yang Dazuo,Zhou Yibing,Zhao Huan.Reference Gene Selection for Quantitative Real-Time PCR in Perinereis aibuhitensis under BPA Exposure[J].Asian Journal of Ecotoxicology,2019,14(1):144-152. |
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| Authors: | Xue Shenglun Huang Yi Sun Ji Yang Dazuo Zhou Yibing Zhao Huan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | BPA Perinereis aibuhitensis reference gene Actin |
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