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DGGE及T-RFLP分析光照下电位对细菌群落的影响
引用本文:吴义诚,邓欢,肖勇,赵峰. DGGE及T-RFLP分析光照下电位对细菌群落的影响[J]. 环境科学, 2014, 35(6): 2328-2333
作者姓名:吴义诚  邓欢  肖勇  赵峰
作者单位:中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021;南京师范大学地理科学学院, 南京 210023;中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021;中国科学院城市环境研究所, 厦门 361021
基金项目:国家自然科学基金项目(21177122,21322703)
摘    要:电位和光照能影响生物电化学系统中产电光合微生物的富集和生长,为了明确电位对细菌多样性的影响,采用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和末端限制性片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)两种方法分析光照条件下电位对电极生物膜细菌群落多样性的影响,实验设置0、0.2、0.4、0.6 V(vs.Ag/AgCl)4个电位.结果表明,0.6 V(vs.Ag/AgCl)下电极生物膜细菌DGGE条带数量较其他处理明显降低,对条带的测序结果显示不同电位下电极生物膜细菌主要属于α-变形菌纲(α-Proteobacteria)、β-变形菌纲(β-Proteobacteria)和梭菌纲(Clostridia).而0.2 V(vs.Ag/AgCl)处理下末端限制性片段(terminal restriction fragment,T-RF)的数量最高,片段数量随电压进一步升高呈现降低趋势.虽然DGGE和T-RFLP两种方法分析结果有一定差异,但都能反映电位对电极生物膜细菌群落多样性影响显著,高电位降低了细菌多样性.

关 键 词:变性梯度凝胶电泳  末端限制性片段长度多态性  细菌群落  电位  光照
收稿时间:2013-09-29
修稿时间:2013-12-14

Effect of the Potential on Bacterial Community Under Illumination by DGGE and T-RFLP
WU Yi-cheng,DENG Huan,XIAO Yong and ZHAO Feng. Effect of the Potential on Bacterial Community Under Illumination by DGGE and T-RFLP[J]. Chinese Journal of Environmental Science, 2014, 35(6): 2328-2333
Authors:WU Yi-cheng  DENG Huan  XIAO Yong  ZHAO Feng
Affiliation:Institute of Urban Environment, Chinese Academy of Sciences, Xiamen 361021, China;School of Geography Science, Nanjing Normal University, Nanjing 210023, China;Institute of Urban Environment, Chinese Academy of Sciences, Xiamen 361021, China;Institute of Urban Environment, Chinese Academy of Sciences, Xiamen 361021, China
Abstract:
Keywords:DGGE  T-RFLP  bacterial community  potential  illumination
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