短花针茅StbCRY1和StbCRY2基因克隆与表达差异分析 |
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引用本文: | 赵鸿彬,白雪,范宇凤,张晓馥,张涛,李淑芬.短花针茅StbCRY1和StbCRY2基因克隆与表达差异分析[J].生态环境学报,2023(5):866-877. |
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作者姓名: | 赵鸿彬 白雪 范宇凤 张晓馥 张涛 李淑芬 |
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作者单位: | 1. 内蒙古农业大学生命科学学院;2. 内蒙古自治区生物制造重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31760154);;内蒙古自然科学基金项目(2021MS03094); |
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摘 要: | 短花针茅(Stipa breviflora)是荒漠草原的优势物种,兼具优秀的饲用价值和稳固水土的重要作用,其生殖生长受外界环境的影响较大。探究野外短花针茅生长发育过程中的CRY1、CRY2蛋白对不同环境条件的响应关系,可以为进一步研究蓝光受体隐花色素在不利环境条件下短花针茅生长发育中的调控机制提供有用的信息。以短花针茅转录组数据为基础,利用RACE技术得到生物钟相关基因StbCRY1和StbCRY2 ORF,其编码区分别为2 695 bp和2 176 bp。二者编码酸性蛋白质,皆是亲水蛋白质。Stb CRY1蛋白具有Phr B结构域和Cry-C结构域,Stb CRY2蛋白具有PhrB结构域。进化树分析表明短花针茅CRY1蛋白与野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)和普通小麦(Triticum aestivum)CRY1进化关系较为相近,短花针茅CRY2蛋白与大麦(Hordeum innermongolicum)CRY2蛋白亲缘关系相近。利用生物信息学工具预测蛋白质二级结构,两种蛋白质出现α螺旋、无规线团概率为40%左右,出现β转角、延伸链的概率较小。共聚焦定位分析表明...
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关 键 词: | 短花针茅 StbCRY1 StbCRY2 表达分析 亚细胞定位 基因克隆 |
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