| 3株紫花苜蓿根瘤菌sinR基因的克隆、序列测定及系统发育分析 |
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| 引用本文： | 陈文峰,李洪波.3株紫花苜蓿根瘤菌sinR基因的克隆、序列测定及系统发育分析[J].应用与环境生物学报,2008,14(2):240-243. |
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| 作者姓名： | 陈文峰 李洪波 |
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| 作者单位： | 中国农业大学生物学院/农业部农业微生物资源及其应用重点开放实验室,北京,100094 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金
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农业部重点实验室基金 |
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| 摘 要： | 为从与紫花苜蓿共生的3株不同根瘤菌(CCBAU 30085、 USDA 1002和CCBAU QH180)中扩增参与根瘤菌群体感应调控的转录激活蛋白基因(sinR基因)并比较它们的不同,根据文献1],设计了一对引物,通过PCR扩增,将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体上,转化大肠杆菌DH5α,经蓝白斑和氨苄青霉素筛选得到阳性转化子.用通用引物测序后将序列与已报道的sinR基因(GenBank登录号为AL591788)进行了同源性比较和系统发育分析.本试验成功克隆到了sinR基因.经同源性及系统发育分析后,结果表明,CCBAU 30085、 USDA 1002和CCBAU QH180这3株菌的sinR基因序列相似性高达99%;它们与已知的Sinorhizobium meliloti 1021中的sinR基因序列相似性到达99 7%～100%,与具有相同功能的豌豆根瘤菌及埃氏菜豆根瘤菌中的raiR基因之间的相似性低于45%.这说明与紫花苜蓿共生的根瘤菌虽然经历了长期的进化,但其sinR基因在长期的进化过程中,却是一个非常保守的基因.
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| 关 键 词： | 群体感应 根瘤菌 sinR基因 紫花苜蓿 草木樨中华根瘤菌 苜蓿根瘤菌 基因 克隆 序列测定 系统发育分析 Cloning Alfalfa Associated Rhizobia Gene Phylogenetic Analysis 进化过程 序列相似性 raiR 菜豆 豌豆根瘤菌 功能 结果 同源性比较 试验 |
| 修稿时间： | 2007年2月1日 |
Cloning, Sequencing and Phylogenetic Analysis of sinR Gene in Three Rhizobia Associated with Alfalfa |
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| CHEN Wenfeng,LI Hongbo.Cloning, Sequencing and Phylogenetic Analysis of sinR Gene in Three Rhizobia Associated with Alfalfa[J].Chinese Journal of Applied and Environmental Biology,2008,14(2):240-243. |
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| Authors: | CHEN Wenfeng LI Hongbo |
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