基于分子对接技术的萘酶促反应速率影响因素 |
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引用本文: | 李兴春,杜显元,褚振华,杨佳雯,顾雯雯,李鱼.基于分子对接技术的萘酶促反应速率影响因素[J].环境化学,2018(4). |
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作者姓名: | 李兴春 杜显元 褚振华 杨佳雯 顾雯雯 李鱼 |
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作者单位: | 中国石油安全环保技术研究院石油石化污染物控制与处理国家重点实验室;华北电力大学环境科学与工程学院资源与环境系统优化教育部重点实验室 |
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摘 要: | 本文引入16种取代基团对顺-萘二氢二醇分子进行修饰,并将顺-萘二氢二醇分子及其修饰后的衍生物与萘代谢关键酶顺-萘二氢二醇脱氢酶进行分子对接,以考察萘酶促反应速率的影响因素.分子对接表明,顺-萘二氢二醇分子基团的疏水性、电负性和体积是影响顺-萘二氢二醇和顺-萘二氢二醇脱氢酶之间亲和力的主要因素;此外,对接构象显示,顺-萘二氢二醇脱氢酶的氨基酸残基与顺-萘二氢二醇分子及其衍生物之间的疏水作用、氢键和空间位阻效应也是影响顺-萘二氢二醇和顺-萘二氢二醇脱氢酶之间亲和力的主要因素,上述因素均可影响萘降解关键步骤的酶促反应速率.
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