芥蓝MAM基因家族成员鉴定、分析及表达 |
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作者姓名: | 陈家璇 陈泽源 赵怡娇 Wang-Pruski Gefu 郭容芳 |
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作者单位: | 1. 福建农林大学戴尔豪西大学联合实验室;2. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;3. 戴尔豪西大学农学院植物食品和环境科学系 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31401859,31772310); |
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摘 要: | 在甘蓝(Brassica oleracea)基因组中鉴定了10个芥蓝(Brassica alboglabra)MAM家族基因,进行生物信息学分析并利用qRT-PCR检测BoMAM在芥蓝6个部位的表达情况.理化性质分析表明,10个BoMAM蛋白序列长度为191-623 aa,相对分子量为21 385.73-67 608.93,理论等电点pI介于5.70-9.43之间;拟南芥(Arabidopsis thaliana)、番茄(Solanum lycopersicum)、芜青(Brassica rapa)、油菜(Brassica napus)和芥蓝的MAM基因家族系统进化树分析显示MAM家族基因可分成2类4个亚家族,物种中MAM基因的亲缘关系符合期望的物种间系统进化关系;MEME分析表明10个BoMAM基因都具有HMGL-like结构域的保守基序结构;染色体定位和进一步分析表明芸薹属全基因组三倍乘事件对BoMAM家族的形成起到重要作用;启动子分析表明BoMAM启动子区域中包含大量光响应、激素响应和逆境响应相关顺式作用元件;qRT-PCR结果表明成员BoMAM1/2/7在种荚中的表达极高,Bo...
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关 键 词: | 芥蓝 MAM基因家族 芥子油苷 生物信息学 表达分析 |
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