| 石斛PRMT基因家族的鉴定及其在不同光周期下的表达 |
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| 引用本文： | 赵桦,张舒婷,刘蒲东,倪珊珊,付帅,叶炜,陈裕坤,林玉玲,徐涵,赖钟雄.石斛PRMT基因家族的鉴定及其在不同光周期下的表达[J].应用与环境生物学报,2022(2):413-422. |
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| 作者姓名： | 赵桦 张舒婷 刘蒲东 倪珊珊 付帅 叶炜 陈裕坤 林玉玲 徐涵 赖钟雄 |
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| 作者单位： | 1. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;2. 三明市农业科学研究院 |
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| 基金项目： | 福建省重大科技专项（2015NZ0002-1）； |
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| 摘 要： | 蛋白质精氨酸甲基转移酶（protein arginine methyltransferases,PRMTs）是真核生物基因组中重要的表观遗传调控因子之一，在植物信号转导、蛋白亚细胞定位和转录调控中发挥着重要作用.基于铁皮石斛基因组数据库，采用生物信息学方法对石斛PRMT基因家族进行成员鉴定，并对其基因结构、蛋白质保守基序（motif）、蛋白质理化特性和启动子顺式作用元件等进行分析.通过qRT-PCR检测DoPRMT在不同组织部位中的表达模式及对不同光周期条件的响应.在铁皮石斛（Dendrobium officinale）基因组上共筛选鉴定到6个PRMT成员，基因结构分析发现，该家族各成员内含子外显子数量有所差异，其中相差数量最多的达到25个.系统进化树可将石斛PRMT家族划分为3种类型（I、II、III）甲基转移酶，石斛中存在I型PRMT有5个，1个II型PRMT,III型甲基转移酶在其中不存在同源序列.保守结构域分析结果显示，该家族成员含有特定的PRMT和PrmA保守结构域，多数成员仅含有PrmA结构域.保守基序分析发现，该家族包含motif数量较多，各成员包含共有的motif1和m...
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 金钗石斛 DoPRMT 表达模式 光周期 |
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