文心兰miR171家族成员鉴定、进化特性及在软腐病侵染过程中的表达

为了解植物miR171家族成员的进化特性及在文心兰侵染软腐病过程中的表达模式，运用生物信息学的方法，从miRbase数据库、文心兰转录组数据库中获取miR171家族48个物种268个前体序列和326个成熟体序列，进行植物学分类、构建进化树、预测二级结构、靶基因预测及实时荧光定量等手段，对文心兰miR171基因家族进行研究.生信分析结果显示：（1）植物miR171家族分布十分广泛，在不同物种间数量分布差异显著，苔藓植物可能是miR171家族进化的祖先，在禾本科植物中进化较完全；（2）系统进化树显示，物种的进化与植物miR171家族成员进化有一定的关系；（3）二级结构预测表明植物miR171家族成员均能形成典型的茎环结构，整体保守性较高，其最小折叠自由能在不同植物中差异显著.为验证以上推论，在文心兰侵染软腐病过程中分析miR171和其靶基因的表达量，结果表明pre-miR171在假鳞茎的相对表达量最高，是根相对表达量的12倍，在叶和根中表达量逐渐减少，且在假鳞茎中随着处理时间的延长，premiR171表达量先上升后下降，而靶基因的表达呈现出与之相反的趋势.本研究表明植物miR171家族成员...