非洲菊SPFH基因家族的鉴定及表达

SPFH(Stomain,Prohibitin,Flotillin and Hflk/C)超家族蛋白是锚定在膜微区的多样化膜蛋白家族，参与调控植物的生长发育、响应生物或非生物胁迫.基于非洲菊转录组数据，利用生物信息学对SPFH(GjSPFH)家族成员进行鉴定，分析其基本理化性质、亚细胞定位和保守氨基酸序列，构建系统进化树，并进行蛋白互作预测.利用转录组FPKM值分析GjSPFHs在非洲菊健康及感病时期的表达水平；利用荧光实时定量技术检测GjSPFH家族成员在不同组织(根、茎和叶片)和不同激素(水杨酸SA和茉莉酸甲酯MeJA)处理下的表达模式.结果表明，非洲菊包含8个GjSPFH成员，其蛋白长度在285-393 aa之间，蛋白理论分子量在31.22×10³-43.14×10³之间，等电点为5.53-9.80，其中有4个蛋白为稳定蛋白，4个为不稳定蛋白；均定位于线粒体，含有15个保守氨基酸序列；GjSPFH可分为3个亚组；该蛋白家族不仅成员之间可以发生互作，还与其他蛋白互作.非洲菊GjSPFH基因家族能够响应根腐病胁迫，GjPHB6在感病时期表达...