龙眼MADS-box基因家族的全基因组鉴定及表达模式

为了解龙眼MADS-box(DlMADS-box)家族的分子进化特性及其对光质、激素的响应，以及该家族成员在龙眼不同组织部位及体胚发生早期的表达模式，对DlMADS-box家族成员进行全基因组鉴定，采用生物信息学方法对其理化性质、进化树、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件、蛋白互作网络进行分析及预测，并分析其在龙眼体胚发生早期、不同组织部位、光照及激素处理下的FPKM值.共鉴定出91个DlMADS-box成员，分为type-Ⅰ型（62个）和type-Ⅱ型（29个）.大部分DlMADS-box为不稳定亲水性蛋白；type-Ⅰ型大部分成员含1个或不含内含子，type-Ⅱ型大部分成员含7个内含子；DlMADS-box所有成员均含有MADS-box结构域（motif1），大部分type-Ⅱ型蛋白含有K-box结构域（motif10）. DlMADS-box启动子区含有光、植物激素和生长发育等顺式作用元件，且发现DlMADS-box蛋白可与该家族成员或其他家族成员之间发生互作.利用转录组数据对DlMADS-boxs成员的表达模式分析显示，大部分DlMADS-box在非胚性愈伤组织阶段中高水平...