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基于16S rRNA测序技术的青藏高原河流细菌群落多样性
引用本文:璩伟卿,张博美,黄雪,任泽,高红凯.基于16S rRNA测序技术的青藏高原河流细菌群落多样性[J].环境科学,2023,44(1):262-271.
作者姓名:璩伟卿  张博美  黄雪  任泽  高红凯
作者单位:华东师范大学地理科学学院, 上海 200241;北京师范大学自然科学高等研究院, 珠海 519087;华东师范大学地理科学学院, 上海 200241;华东师范大学地理信息科学教育部重点实验室, 上海 200241
基金项目:国家自然科学基金项目(42122002,42071081)
摘    要:近年来由于气候变化和人类活动等影响,我国青藏高原生态系统面临退化风险.微生物作为河流生态系统的重要组成部分,能够反映流域的总体变化,是生态系统健康程度的指示器.为调查青藏高原河流生态系统的细菌群落多样性和组成特点,于2021年7月在青藏高原地区的黄河、长江、澜沧江、怒江、雅鲁藏布江和柴达木盆地流域进行大范围水样采集,共收集样品65个,并基于16S rRNA技术对样品中细菌进行测序分析.结果表明,共检测出的细菌群落涵盖65门1 311属,各流域α多样性指数较高,说明青藏高原河流细菌的丰富度和多样性均处于较高水平.其中,表征物种丰富度的Chao指数和OTU richness指数均与SRP/TP的值有极显著负相关关系.门水平优势类群主要有变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)、放线菌门(Actinobacteriota)和蓝细菌门(Cyanobacteria);纲水平优势类群主要有γ-变形菌纲、拟杆菌纲和α-变形菌纲;属水平优势群主要有Flavobacterium和Limnohabitans.通过主坐标分析(PCoA)和置换多因素方差分析(Adonis...

关 键 词:16S  rRNA  青藏高原(QTP)  河流  微生物多样性  流域
收稿时间:2022/2/18 0:00:00
修稿时间:2022/5/7 0:00:00

Bacterial Community and Diversity of River Ecosystems on the Qinghai-Tibet Plateau Based on 16S rRNA Gene Sequencing
QU Wei-qing,ZHANG Bo-mei,HUANG Xue,REN Ze,GAO Hong-kai.Bacterial Community and Diversity of River Ecosystems on the Qinghai-Tibet Plateau Based on 16S rRNA Gene Sequencing[J].Chinese Journal of Environmental Science,2023,44(1):262-271.
Authors:QU Wei-qing  ZHANG Bo-mei  HUANG Xue  REN Ze  GAO Hong-kai
Institution:School of Geographic Sciences, East China Normal University, Shanghai 200241, China;Advanced Institute of Natural Sciences, Beijing Normal University, Zhuhai 519087, China; School of Geographic Sciences, East China Normal University, Shanghai 200241, China;Key Laboratory of Geographic Information Science, Ministry of Education, East China Normal University, Shanghai 200241, China
Abstract:
Keywords:16S rRNA|Qinghai-Tibet Plateau(QTP)|river|microbial diversity|watershed
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