长江中下游环境DNA宏条形码生物多样性检测技术初步研究

长江生物多样性在人为影响下面临严重威胁,物种监测是生物多样性保护的基础,为完善长江水生态监测体系,实现高效无损伤的物种监测,在长江中下游干流3个江段（新滩、安庆和芜湖）采集水样,建立长江水样环境DNA宏条形码物种检测体系并评估其有效性.结果表明:①长江中下游环境DNA宏条形码检测到32个物种,包括20种鱼类、1种水生哺乳动物（长江江豚）和11种陆生动物,其中鱼类物种包括鲤形目、鲇形目、鲈形目和鲱形目,其种数占鱼类总种数的比例分别为60%、25%、10%和5%.②长江中下游渔获物中资源量居首位的鲤形目在环境DNA调查中序列数最多,占鱼类总序列的96.2%,其次为鲱形目（占比为3.5%）,鲇形目和鲈形目占比较低,分别为0.2%和0.1%,4个类目序列相对丰度与渔获物种资源量组成差异较大.③环境DNA调查次数约占传统渔获物调查次数的几十至几百分之一,采样时间不足努力量最少的渔获物调查的1%,检测到的鱼类种数为传统调查总数的31%~49%.④安庆采样点位于长江中下游长江江豚密度最高的江段,其环境DNA检出率和序列相对丰度在3个采样点中均最高.研究显示:长江水样环境DNA包含水陆复合生态系统的生物多样性信息,利用水样环境DNA宏条形码可检测不同类群的水生和陆生物种;对于鱼类物种检测,环境DNA宏条形码比传统调查方法效率更高,可对传统调查结果进行补充;环境DNA宏条形码生物多样性检测主要受分子标记体系和核酸序列数据库限制,获取全面的物种多样性和资源量信息需要对检测分析方法进行进一步完善.      

基于线粒体Cyt b序列的雅砻江长丝裂腹鱼群体遗传结构分析

该研究测定了2018年间采集于雅砻江干流甘孜、雅江、锦屏和金河江段的4个长丝裂腹鱼野生群体共118尾个体的线粒体细胞色素Cyt b基因全序列，以评估其遗传多样性和遗传结构。结果显示：118条长丝裂腹鱼序列共定义了19个单倍型，29个多态位点，总群体单倍型多样性指数（Hd）为0.850 ± 0.017，核苷酸多样性指数（π）为0.003 35 ± 0.001 89，各群体Hd范围0.697 ± 0.069 ~ 0.831 ± 0.022，π范围0.000 92 ± 0.000 79 ~ 0.006 22 ± 0.003 36。中性检验结果表明，Tajima′s D 和Fu′s Fs均为显著性负值，单倍型核苷酸不配对分布呈典型单峰，表明雅砻江长丝裂腹鱼经历过种群扩张事件。分子方差分析（AMOVA）表明，84.84%的分子差异来源于群体内部，15.16%的分子差异来源于群体之间。FST值统计检验表明，除甘孜群体和雅江群体之间差异不显著外，其余两两群体之间FST值统计检验均显著。根据研究所揭示的雅砻江长丝裂腹鱼种群遗传结构特征，尽管群体之间存在显著的遗传分化，但分化水平仍属于种群内分化，建议将分布在雅砻江干流的长丝裂腹鱼作为一个整体进行保护。     

观音岩水电站蓄水前后金沙江攀枝花江段鱼类群落结构及变化特征

基于2013~2017年金沙江干流攀枝花江段的鱼类资源监测数据，分析了观音岩水电站蓄水前后该江段的鱼类群落结构特征及变化情况。5年共监测到鱼类65种，长江上游特有鱼类共20种，5年均监测到的鱼类有12种，其中11种为喜流水性鱼类。各年度鱼类多样性指数呈现一定波动。ABC曲线及W统计表明2013和2014年鱼类群落结构未受到扰动，但在观音岩水电站蓄水运行后受到严重干扰。CA和NMDS分析显示鱼类群落可以分为两组，组I包括2013和2014年，组II包括2015、2016和2017年，one-way ANOSIM显示这2组在统计学上没有显著性差异。对聚类结果进行SIMPER分析结果显示，在观音岩水电站运行后，产漂流性卵的鱼类丰度明显降低，如圆口铜鱼、长鳍吻鮈等。因此，为了更好地保护攀枝花段的鱼类资源，应采取包括就地或迁地保护、生态调度和人工繁殖放流的针对性措施。     

金沙江二期工程蓄水前下游皎平渡江段产漂流性卵鱼类产卵场现状

为了解金沙江二期工程白鹤滩、乌东德水库蓄水前，金沙江下游产漂流性卵鱼类产卵场现状，2016～2018年在皎平渡江段使用弶网对产漂流性卵鱼类早期资源开展调查。结果显示:金沙江下游皎平渡江段产漂流性卵鱼类有7种，其中长江上游特有鱼类5种，分别为中华金沙鳅（Jinshaia sinensis）、长薄鳅（Leptobotia elongata）、圆口铜鱼（Coreius guichenoti）、长鳍吻鮈（Rhinogobio ventralis）和红唇薄鳅（Leptobotia rubrilabris）。2016～2018年产漂流性卵鱼类产卵量分别为2 140.0×104、2 189.9×104、2 486.2×104粒，产卵场主要分布在元谋县、永仁县、平地镇、金江镇和格里坪镇5个江段。金沙江下游皎平渡以上江段产漂流性卵鱼类产卵规模较大，但在二期工程蓄水后部分江段将成为淹没区，其产卵繁殖活动将会受到一定程度的影响。针对研究结果，建议对乌东德库尾以上干支流流水江段开展生境保护和修复。     

长江中游监利江段鱼类群落结构研究

基于2013~2015年、2017~2018年长江中游监利江段的鱼类资源监测数据，采用多样性指数和多元统计方法分析该江段的鱼类群落结构特征。研究表明:5年共监测到鱼类68种，隶属于6目13科，其中鲤形目共46种；2018年监测的鱼类种类数要多于其他年份。各年份的均匀度指数值相差不大，2018年Shannon Wiener指数值和Margalef丰富度指数值要大于前面4个年份，优势度指数值有一定波动，但值均偏低。ABC曲线及W统计表明2013年和2014年鱼类群落结构受到了人类活动的严重扰动，而2015、2017和2018年受到人类活动的扰动程度不大。聚类分析和非度量多维尺度分析显示鱼类群落可以分为三组，但相似性分析表示三组间无明显差异。     

珠江大藤峡工程蓄水初期对鱼类生物完整性的影响与减缓对策

鱼类生物完整性指数(F-IBI)评价是进行河流生态系统健康评估的重要基础，也是开展河流生态修复的前提条件。为探究珠江流域大藤峡水利枢纽工程影响水域鱼类资源和栖息生境受人为干扰的影响情况，基于2020～2021年鱼类资源现状以及历史文献资料，构建了基于F-IBI的水生态健康评价体系，评估了大藤峡工程影响水域鱼类生物完整性状况及其受胁迫程度。总体上，大藤峡工程蓄水前后工程影响水域F-IBI变化不大，评价等级均为“一般”,但与历史数据相比，现状调查中珍稀特有鱼类种类数下降明显、外来物种数量有所增加；库尾和典型支流河段鱼类生物完整性水平优于库区和坝下河段。建议长期跟踪评价F-IBI变化情况，识别大藤峡工程蓄水运行造成的生态影响以及水生态保护措施效果，进一步落实开展库尾生境修复、生态调度、外来物种防控等措施，提高区域水生态健康状况。